文件名称：CNV-Sim:拷贝数变化（CNV）模拟器
文件大小：29.14MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-17 19:52:45
Python
拷贝数变化模拟器（CNV-Sim） 在基因组学中，拷贝数变异（CNV）是基因组中一种结构变异，其中基因组的各个部分被复制或缺失。 人群中个体之间变异（重复/缺失）的数量有所不同。 拷贝数变异模拟器（CNV-Sim）是一种仿真工具，可扩展现有的下一代测序读码模拟器的功能，以在生成的读物中引入拷贝数变异。 所得的读段包括根据变体区域的预定义列表的扩增以及缺失。 CNV-Sim帮助测试和基准测试工具进行拷贝数变化检测和分析。 该工具提供两种类型的仿真： 整个基因组中的CNV模拟。 CNV-Sim利用的功能在基因组中引入变异。 靶向外显子组中的CNV模拟。 CNV-Sim利用的功能在目标中引入变化。 使用CNV-Sim 作为独立应用程序下载 运行适合您的操作系统的安装脚本，以安装必需的依赖项。 或者，在您的计算机上安装以下依赖项（安装脚本会为您完成所有操作）： 下载，然后将二进制文件a
【文件预览】：
CNV-Sim-master
----Dockerfile(987B)
----cnvsim()
--------Wessim()
--------genome_simulator.py(10KB)
--------ART()
--------fileio.py(4KB)
--------__init__.py(0B)
--------exome_simulator.py(14KB)
----README.md(8KB)
----setup-linux.sh(636B)
----setup-mac.sh(900B)
----cnv-sim.py(6KB)
----.gitignore(9B)