SLiM

时间:2021-03-09 11:41:00
【文件属性】:
文件名称:SLiM
文件大小:495KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-09 11:41:00
Slim 黑色素等位基因模拟 模拟场景的说明 我使用SLiM在3种垫脚石情况下模拟黑色素等位基因。 当然,这些场景在空间上不是完全明确的,但是它们是准空间的,因为迁移在某些方向上受到限制。 SLiM可以进行完全的空间显式仿真,但是我认为我会首先尝试这些更简单的模型。 在所有情况下,迁移率都是对称的,并且等于0.01。 三种情况的基本结构是: 方案1(稳定的人口规模)-共有20000个人分布在连接在海岸的三个线性垫脚石“手指”(西庸,里马克和卢林谷)上。 您可以单击该图像以在另一个较大的窗口中将其打开。 方案2(指数增长)-模拟开始时有9000个个体,沿海Rimac亚群到模拟结束时呈指数增长到12,000个个体(第10000代总共20000个个体)。 您可以单击该图像以在另一个较大的窗口中将其打开。 方案3(范围扩展)-在模拟开始时有8000个个体,沿海Rimac亚种群以放射状方式播种新的亚种群
【文件预览】:
SLiM-main
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----genertations_base_model_selection.txt(11KB)
----genertations_base_model_assortative_mating.txt(9KB)
----base_model_range_expansion.slim(24KB)
----README.md(4KB)
----genertations_base_model_range_expansion.txt(13KB)
----base_model_selection_assortative_mating.slim(8KB)
----genertations_base_model_exponential_growth_selection.txt(11KB)
----scenario_1.png(11KB)
----genertations_base_model_exponential_growth_selection_assortative_mating.txt(10KB)
----fst.png(33KB)
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----genertations_base_model_exponential_growth_assortative_mating.txt(9KB)
----scenario_3.png(132KB)
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----scenario_2.png(25KB)
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----base_model_range_expansion_selection_assortative_mating.slim(30KB)
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----allele_persistenece.png(32KB)

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