文件名称：同步传输matlab代码-cabox:柜子
文件大小：235KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-24 01:36:52
系统开源
同步传输matlab代码细胞组装工具箱 这个 repo 收集了用于评估听觉皮层神经元细胞组装特性的代码。 神经科学的一大挑战是从大量神经元的活动中获得洞察力。 我们知道人口编码可以增加信息传递并使感官信息的传递更不受噪声影响，但是很少有方法可以提供系统分析以及适当的统计假设检验来理解数据。 此 repo 收集用于此类分析的函数。 我们的目标是寻找一起活跃的神经元组——它们是功能React网络的一部分。 这些神经元组被称为细胞组件。 对于听觉皮层中的细胞组装分析，我们使用多通道记录探针同时记录了许多神经元。 平均而言，这会产生 60-90 个神经元，记录时间为 10-15 分钟。 目标是确定这 90 个神经元中的哪些组是同步活动的。 因此，我们希望查看 90 个子网中存在哪些子网。第一步是对数据进行尖峰排序，然后将尖峰序列分入 5 ms 分块。 然后对尖峰序列进行 z 评分以通过响应的幅度进行归一化。 接下来，将尖峰序列收集到一个大矩阵中，获得相关矩阵，并使用 PCA 分解该矩阵。 最后，通过将 ICA 应用于重要的 PCA 组件来获得单个单元组件。 此过程查找单元组件。 现在我们想走得
【文件预览】：
cabox-master
----ca_plot_cadata_raster_corrmat.m(4KB)
----example_14700.eps(49KB)
----ca_training_set_indices.m(1KB)
----ca_error_check_fio.m(1KB)
----ca_plot_cadata_grant_figure.m(6KB)
----ca_cadata_stc_projection.m~(8KB)
----ca_get_sta_train_from_locator.m(2KB)
----ca_cat_get_ripple_noise_stimulus.m(4KB)
----ca_sig_sta_from_stim_obs_resp.m(2KB)
----ca_get_ripple_noise_number_from_spk_filename-justin.m(1KB)
----ca_ripple_stim_spktrain.m(2KB)
----ca_info_fraction.m(2KB)
----ca_get_sta_stim_projection.m(2KB)
----example_14700.ai(109KB)
----ca_get_base_downsampled_spr_filename.m(2KB)
----ca_plot_assembly_members_sta.m(2KB)
----ca_batch_calc_sta_info_from_subset.m(2KB)
----ca_batch_calc_cell_assembly_sta_stim_binsize.m(4KB)
----ca_calc_projection_from_sta_stimulus_spktrain.m(2KB)
----ca_batch_calc_cell_assembly_surrogate_sta_fio_spktrain.m(4KB)
----ca_folder_plot_cadata_exp_site_stim_dft.m(7KB)
----ca_info_px_pxspk.m(672B)
----ca_spkmatrix_to_ensembles.m(6KB)
----ca_jitter_spk_example.m(1KB)
----ca_plot_cell_assemblies_data.m(5KB)
----ca_sta_from_locator_stimulus.m(1KB)
----ca_identify_assembly_members.m(554B)
----ca_plot_cell_assemblies_exp_site_cadata.m(5KB)
----ca_plot_nedata_examples.m(6KB)
----cajitter.vim(12KB)
----ca_get_ripple_noise_number_from_spk_filename.m(2KB)
----example2_14700.eps(74KB)
----ca_calc_cell_assembly.m(2KB)
----ca_sta_stimulus_projection.m(1KB)
----ca_calc_cell_assembly_spike_jitter.m(3KB)
----ca_cat_batch_calc_cell_assembly_sta_stim_binsize.m(4KB)
----example_14700_colorbar.eps(50KB)
----KendallCoef.m(769B)
----ca_plot_cadata_for_paper.m(8KB)
----ca_batch_calc_cell_assembly_sta_fio_fit.m(2KB)
----ca_spkloc_stc_projection.m(8KB)
----ca_calc_surrogate_spktrain_from_sta_fio.m(11KB)
----ca_get_cell_assembly_spktrain.m(1KB)
----ca_plot_arranged_sta.m(2KB)
----ca_get_cell_assembly_sta_info.m(13KB)
----README.md(2KB)
----ca_create_spktrain_matrix_from_stimulus_spk.m(2KB)
----ca_assembly_patterns_permutation.m(6KB)
----ca_method_demo_pca_ica.m(12KB)
----ca_create_stim_trial_from_stim_matrix.m(2KB)
----ca_jitter_spktrain_matrix_from_stimulus_spk.m(3KB)
----ca_subset_info_from_data_fraction.m(1KB)
----ca_kendallw_spktrain.m(238B)
----cell_assembly_analysis_outline.m(966B)
----ca_plot_multi_cadata_corrmat_ensembles.m(5KB)
----ca_plot_cadata_stc_projection.m(6KB)
----ca_plot_cadata_corrmat_ensembles.m(5KB)
----ca_calc_ICA_threshold.m(2KB)
----ca_proj2fio.m(4KB)
----ca_calc_cell_assembly_nonlinearity_from_cadata_stimulus.m(3KB)
----ca_calc_cell_assembly_nonlinearity_fit.m(7KB)
----ca_plot_cadata.m(5KB)
----ca_batch_calc_cell_assembly_nonlinearity_fit.m(2KB)
----ca_threshold_cadata_activities.m(1KB)
----ca_detect_cell_assemblies_data.m(1KB)
----ca_plot_cadata_stc_evals_evecs.m(4KB)
----ca_calc_sta_from_stimulus_spktrain.m(1KB)
----ca_plot_fio_prob.m(3KB)
----ca_calc_sta_info_from_subsets.m(6KB)
----ca_calc_fio_prob_from_proj_spktrain.m(2KB)
----ca_stc_sig_evals_evecs.m(1KB)
----ca_info_fraction_mean_std.m(932B)
----ca_ringach_malone_func.m(2KB)
----ca_cadata_stc_projection.m(8KB)
----ca_calc_fio_from_stim_resp.m(3KB)
----ca_batch_spet2train.m(1KB)
----ca_get_sta_from_locator.m(1KB)
----ca_dir_wrapper_surrogate_sta_fio_spktrain.m(4KB)
----ca_calc_fio_from_stim_sta_proj.m(4KB)
----ca_get_ripple_noise_number_from_stim.m(588B)
----ca_get_ripple_noise_stimulus.m(4KB)
----tmp_trained_control_plot_fio_params.m(9KB)
----ca_calc_fio_from_stimulus_spktrain.m(3KB)
----ca_batch_calc_cell_assembly_nonlinearity.m(2KB)
----ca_plot_activation_strength.m(4KB)
----ca_calc_cell_assembly_sta_from_spk_stimulus_trigger.m(4KB)
----KendallW.m(1KB)
----erfcore.m(4KB)
----ca_batch_calc_cell_assembly_sta_info.m(2KB)
----ca_info_extrapolate.m(827B)
----ca_plot_cell_assembly_stamat.m(2KB)
----ca_sta_stimulus_spktrain_fio.m(3KB)