文件名称:synvisio:SynVisio是一种交互式多尺度可视化工具,可让您探索McScanX的结果,McScanX是一种流行的协同和共线性检测工具包
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更新时间:2024-05-18 08:00:37
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SynVisio SynVisio是一种交互式多尺度可视化工具,可让您探索McScanX的结果,McScanX是一种流行的协同和共线性检测工具包以及DAGChainer(类似工具)。 SynVisio可从免费使用。 SynVisio需要运行两个文件: 简化的gff文件,用作McScanX查询的输入。 共线性文件,由McScanX作为同一输入查询生成为输出。 从共线性文件中读取有关为McScanX设置的参数和共线性基因的百分比份额的常规信息,并与曲线图一起显示。 用户可以使用动态过滤器面板选择源染色体和目标染色体以及图的类型,还可以重新排列染色体的布局。 出版物引文 如果您在研究出版物中使用我们的工作,请考虑引用我们的工作。 旺卡·班迪(Venkat Bandi)和卡尔·古特温(Carl Gutwin)。 2020年。基因组保护的互动探索。 在“第46届图形界面会议论文集2020