basespace-igv:IGV的BaseSpace版本

时间:2021-05-16 12:37:34
【文件属性】:
文件名称:basespace-igv:IGV的BaseSpace版本
文件大小:24.3MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-16 12:37:34
Java BaseSpace IGV 是功能齐全的基因组浏览器,可让您详细可视化序列数据。 我们修改了IGV,以显示来自BaseSpace的对齐和变体数据(BAM和VCF文件)。 这样,您可以在BaseSpace中启动“重测序”或“扩增子”工作流后执行变体分析。 IGV保留其所有本机功能,包括从本地计算机加载数据。 IGV中的BaseSpace数据 BaseSpace文件浏览器在BaseSpace中显示可在IGV中查看的数据。 所显示的目录结构取决于BaseSpace中数据的组织方式。 一个项目是*别的目录,它包含一个或多个AppResults。 如果AppResult是分析单个样本的结果,则样本名称将附加到AppResult名称之后。 每个AppResult包含零个或多个文件。 对齐(BAM),变体(VCF),BigWig(BW),BED和BedGraph文件显示在文件浏览器中。 双击

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