文件名称:GTEx_exploration:来自基因型组织表达项目的RNA-seq数据分析包含自闭症相关重复扩展的基因
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更新时间:2024-03-30 00:35:36
JupyterNotebook
GTEx_exploration 基因型组织表达项目的RNA-seq数据分析包含自闭症相关重复序列扩展的基因。 该项目的背景是一项遗传研究,由Trost B.等人在《自然》杂志2020年发表(Trost B,Engchuan W,Nguyen CM,Thiruvahindrapuram B,Dolzhenko E,Backstrom I等人。自闭症中扩增的DNA重复序列,自然[互联网],2020年; 586(十月),可从以下网站: : 。 这项研究显示,在自闭症患者中发现的55个不同基因中,串联DNA重复序列(STRs)的扩增。 在当前项目中,来自基因型组织表达项目(GTEx,Aguet F,Brown AA,Castel SE,Davis JR,He Y,Jo B等)的13种脑组织的可公开获得的RNA序列数据。 。Nature。2017; 550(7675):204-13。),结
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GTEx_exploration-main
----README.md(3KB)
----GTEx_Analysis_v8_Annotations_SubjectPhenotypesDD.xlsx(10KB)
----GTEX_exploration.ipynb(6.56MB)
----GTEx_Analysis_v8_Annotations_SubjectPhenotypesDS.txt(20KB)
----STRs_genotypes.txt(67KB)
----GTEx_Analysis_v8_Annotations_SampleAttributesDS.txt(10.98MB)
----GTEx_Analysis_v8_Annotations_SampleAttributesDD.xlsx(15KB)
----GTEX_exploration.py(39KB)