【文件属性】:
文件名称:matlabauc代码-BiRW:双随机游动的表型-基因关联预测
文件大小:3KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-24 10:06:47
系统开源
Matlab的耳语BiRW
双随机行走表型-基因关联预测。
只需在matlab中运行“
birw_mn_main”即可。
将执行具有默认参数(alpha
=
0.8,m
=
4和n
=
4)的算法BiRW,并且还可以执行评估,可以显示平均AUC分数最高为50、100、300、500、1000以及全部。
您也可以在“
birw_mn_main.m”中更改参数。
文件列表:“
birw_mn_main.m”在此脚本文件中调用源代码的主要条目,BiRW算法和评估过程。
“
birw_mn.m”在该函数中实现算法BiRW“
roc_test_eval.m”在OMIM
May-2010中具有新关联的评估(g_p_network_emerge.mat),并由birw_mn_main.m调用。“
ROC.m”
AUC函数用于排名列表,并由roc_eval.m调用
数据文件:“
phenotype_logistic.mat”表型相似性网络用作表型网络。
基于van
Driel
2006的表型相似度矩阵,使用逻辑函数将相似度评分转换为逻辑评分。
“
ppi_network.mat”蛋白质-蛋白质相互作用
【文件预览】:
BiRW-master
----birw_mn.m(1KB)
----ROC.m(645B)
----roc_test_eval.m(1KB)
----birw_mn_main.m(1KB)
----README.md(2KB)