基因序列对比

【文件属性】：
文件名称：基因序列对比
文件大小：9KB
文件格式：JAVA
更新时间：2017-01-31 13:35:27
java DNA 类基因由4种核苷酸 分别用字母ACTG表示 要求编写一个程序 按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度 即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG 它们有多相似呢 测量两个基因的相似度一种方法称为对齐 使用对齐方法可以在基因的适当位置加入空格 让两个基因的长度相等 然后根据基因的分值矩阵计算分数 A C G T A 5 1 2 1 3 C 1 5 3 2 4 G 2 3 5 2 2 T 1 2 2 5 1 3 4 2 1 比较AGTGATG与GTTAG 第一种对齐方案为： 首先可以给AGTATG插入一个空格得：AGTAT G GTTAG插入3个空格即得： GT TAG 上面的匹配分值为: 3+5+5+ 2 + 3 +5+ 3 +5 9 第二种对齐方案为： AGTGATG GTTA G 得到的分值为： 3 +5+5+ 2 +5+ 1 +5 14 当然还有其它对齐方式 但以上对齐方式是最优的 所以两个基因的相似度就为14 ">类基因由4种核苷酸 分别用字母ACTG表示 要求编写一个程序 按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度 即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG 它们有多相似呢 测量两个基因的相似度一种方法称为对齐 使用对齐方 [更多]