【文件属性】：
文件名称：m6A:用于 m6A 研究的 Perl 脚本（2014）
文件大小：17KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-06-18 00:34:04
Perl
m6A 研究（生物信息学分析）中使用的核心命令和自定义 Perl 脚本
1. 原始测序reads的质量控制
1) 使用 cutadapt 修剪掉低质量的核苷酸（Phred 质量低于 20）和 3' 末端的 Illumina 接头序列
对于 i 在 "s_6_In_C13" "s_6_In_C15" "s_6_In_C18" "s_6_In_C20" "s_6_In_C3" "s_6_In_C8" "s_6_IP_C13" "s_6_IP_C15" "s_6_IP_C15" "s_6_IP_C15" "s_1" "q_sub_C15" "s_1" "q_sub_IPs_ip_c6_IPs_q_sub_c6_IPs_q_sub_c_6_IPs_q_sub_c6_IPs_q_sub_c_6_IPs_q_sub_C20 i.qsubout -by -cwd -l h_vmem=50G -N $i
【文件预览】：
m6A-master
----RNAMethy_MotifFinder2_Cluster.pl(3KB)
----RNAMethy_GetUniqSummit.pl(813B)
----RNAMethy_CombineUniqSummit.pl(1KB)
----RNAMethy_winscore.pl(8KB)
----RNAMethy_MotifFinder3_PSSM.pl(3KB)
----RNAMethy_Summit_TTest.pl(4KB)
----Discard_fastq_PE.pl(2KB)
----RNAMethy_GetUniqSummit2.pl(3KB)
----RNAMethy_GenomicLocation.pl(9KB)
----RNAMethy_AddGenomicLocation_Case.pl(4KB)
----README.md(9KB)
----RNAMethy_MotifFinder1_Kmer.pl(3KB)