使用python实现BLAST
最近在自学python,又用python实现了一下BLAST。 这次更新了打分函数如下,空位罚分改为-5,但不区分gap open 和 gap extend。
linux 下更改 blast+ version
to2.2.30cd/usr/binsudosumvblastdb_aliastoolblastdb_aliastool_2.25mvblastdbcheckblastdbcheck_2.25mvblastdbcmdblastdbcmd_2.25mvblast_formatterblast_form...
Can I run a local BLAST search again multiple blast databases simultaneously?
from:https://secure.clcbio.com/helpspot/index.php?pg=kb.page&id=113CanIrunalocalBLASTsearchagainmultipleblastdatabasessimultaneously?(blast,blastn...
Blast在windows下的使用过程
老师要做一个关于生物信息工程的网站,一个同学要负责网站的搭建,让我来研究blast。但是这个软件的教程太少了,在看的过程中走了不少弯路。写个文章记录一下,以便以后使用。同时还会根据项目的进程进行更新。---2019/10/24一、说明Blast,全称BasicLocalAlignmentSearch...
UVALive 4426 Blast the Enemy! --求多边形重心
题意:求一个不规则简单多边形的重心。解法:多边形的重心就是所有三角形的重心对面积的加权平均数.关于求多边形重心的文章: 求多边形重心用叉积搞一搞就行了。代码:#include<iostream>#include<cstdio>#include<cstring>#i...