文件名称：sra_metadata_toolkit:使使用 SRA 元数据变得简单
文件大小：4.39MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-21 04:51:33
Ruby
SRA 元数据工具包
目前托管在作为测试版。 （有时React很慢，抱歉！）
目录
1 这是什么
2 使用方法
2.1 SRA ID 转换器
2.2 SRA 元数据解析器
2.3 FastQC 结果2.3.1 读取文件
3 发展
3.1 关于本项目
3.2 许可
1 这是什么
SRA Metadata toolkit 是使用 Sequence Read Archive 中存档的 NGSeq 数据元数据的项目和 Web 服务。 它允许命令行访问以获取解析为查询指定的 JSON 格式数据。 它还提供每个序列数据的质量摘要。 详细信息和更新在。
2 使用方法
用户可以通过指定查询来获取部分或全部元数据。
2.1 SRA ID 转换器
将 SRA ID 转换为所属/相关 ID。 JSON 格式输出
/idconvert/
【文件预览】：
sra_metadata_toolkit-master
----sra_metadata_parser.rb(12KB)
----handler.rb(2KB)
----sra_id_converter.rb(6KB)
----fix_metadata_directory.rb(598B)
----sync_and_unzip_spec.rb(770B)
----resources()
--------website()
----fastqc_result_parser.rb(6KB)
----fastqc_utils.rb(6KB)
----.gitignore(83B)
----README.md(3KB)
----ebi_metadata_parser.rb(2KB)
----sync_and_unzip.rb(2KB)