【文件属性】：
文件名称：matlab分时代码-whiteway-et-al-2019-nbdt:Whiteway等人2019中用于运行分析的代码
文件大小：50KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-21 21:48:31
系统开源
matlab分时代码使用潜在变量模型表征皮层神经元群体共有变异的非线性结构
该存储库包含用于复制Whiteway等进行的分析的代码。
利用潜在变量模型表征皮质神经元群体共有变异的非线性结构。
说明位于下面。
步骤1：获取数据
我们分析了两个公开可用的数据集。
V1数据集。
我们分析了Kohn实验室的电生理数据，该数据已由CRCNS在公开提供。
响应于在1280毫秒（200次重复）中呈现的具有12个等距方向的全对比度漂移光栅，用犹他州阵列在三只麻醉过的猕猴的主视觉皮层中记录了尖刺活动。
完整的细节可以在原始论文中找到。
如果尚未从CRCNS访问数据，则必须首先请求访问权限（详细信息）。
将包含原始数据的pvc-11目录放在目录中的任何位置；
我们稍后将在Matlab配置文件中指定位置。
PFC数据集。
我们还分析了Kiani实验室的电生理数据，该数据已在（先弓状回的种群React）处公开提供。
当三只猕猴执行方向辨别任务时，在犹他前回的8Ar区域中的犹他州阵列中记录了突刺活动。
在每项试验中，猴子都受到800毫秒的随机点运动刺激，并且在可变长度的延迟时间后，猴子通过向相应方向移动目标来报
【文件预览】：
whiteway-et-al-2019-nbdt-master
----.gitignore(11B)
----README.md(11KB)
----scripts-gam()
--------buildModelFitStruct.m(27KB)
--------getGamPredictions.m(4KB)
--------scriptFitPreviousModels.m(4KB)
--------buildGamXmats.m(2KB)
--------run_srlvms.sh(2KB)
--------fitGamSeries.m(9KB)
--------run_previous_models.sh(1KB)
--------scriptFitSRLVMs.m(6KB)
--------fitGams.m(7KB)
--------fitGamsLoo.m(10KB)
--------scriptFitGAMs.m(4KB)
--------run_gams.sh(3KB)
--------evalGam.m(3KB)
----scripts-stim-models()
--------run_stimulus.sh(1KB)
--------buildStimMatrix.m(1KB)
--------fitStimModels.m(6KB)
----LICENSE(1KB)
----sim-data()
--------createSimData.m(1KB)
--------fit_loop.m(5KB)
--------getIndxReps.m(288B)
----plotting()
--------clean_plot.m(114B)
--------figure_plotting.m(18KB)
--------README.md(3KB)
--------fig4_gam_vs_srlvm.m(4KB)
--------model_scatter_all_plot_helper.m(1KB)
--------fig2_iso_qi.m(2KB)
--------model_scatter_plot_helper.m(823B)
--------fig2_model_comparison.m(3KB)
--------fig2_tuning_curves.m(4KB)
--------assign_line_properties.m(3KB)
----preproc()
--------kiani.m(2KB)
--------kohn.m(2KB)
----util()
--------getIndices.m(2KB)
--------getSimpleR2.m(274B)
--------configProjDirs.m(748B)
--------loadData.m(850B)
--------startup.m(174B)
--------normalizeData.m(470B)
--------getDatasetStrings.m(841B)