vennt:差异基因表达的动态维恩图

时间:2021-07-14 09:28:56
【文件属性】:
文件名称:vennt:差异基因表达的动态维恩图
文件大小:239KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-07-14 09:28:56
JavaScript 文特 用于探索差异表达基因列表的动态维恩图 尝试 示例截图 用法 作为单个 HTML 文件 使用 Cuffdiff 输出 下载这个 python 脚本 (需要 python >=2.7)。 然后只需运行: python vennt.py --cuffdiff gene_exp.diff > my-vennt.html 这将创建一个可以共享的单个 html 文件。 使用通用 CSV 文件 生成一个包含所有基因列表的 CSV 文件。 CSV 的每一行都应包含有关基因的信息,包括对log fold change和adjust p-value 。 使用单列指定基因列表(参见下面的示例)。 每个基因必须有一个唯一的标识符,用于在不同的基因列表中查找相应的基因。 下载这个 python 脚本 (需要 python >=2.7)。 然后,如果您的 CSV 列名称与默认值匹配,只需按如下方式运行它:
【文件预览】:
vennt-master
----css()
--------slick.grid.css(3KB)
--------images()
--------dge.css(3KB)
--------bootstrap-tour.min.css(925B)
--------venn.css(310B)
----.travis.yml(157B)
----example()
--------test.html(792B)
--------test.coffee(1KB)
----images(10B)
----Changelog.txt(1KB)
----index.html(568B)
----COPYING.txt(34KB)
----app()
--------slider.coffee(621B)
--------templates()
--------version.coffee(32B)
--------utils.coffee(866B)
--------proportion-venn.js(22KB)
--------tour.coffee(4KB)
--------main.coffee(579B)
--------venn.coffee(5KB)
--------lib()
--------dge.coffee(19KB)
----build-embed.sh(900B)
----.gitignore(53B)
----README.md(5KB)
----build.sh(552B)
----embed.py(6KB)

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