卷云

时间:2024-03-08 14:24:55
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更新时间:2024-03-08 14:24:55

Python

卷云NGS 针对全基因组/全外显子组DNA-Seq中RNA-seq,miRNA-seq,ChIP-seq,RNAEditing和变体调用的云优化主分析管道。 介绍 大规模下一代测序(NGS)数据的仿生分析需要大量的计算资源。 尽管云计算按需提供了这样的处理能力,但是动态计算集群的管理对于大多数正在工作的生物学家来说是艰巨的任务。 为了解决这个难题,加利福尼亚大学圣地亚哥分校的计算生物学和生物信息学中心开发了Cirrus-NGS,这是使用Amazon Web Services(AWS)进行常见NGS分析的交钥匙解决方案。 Cirrus-NGS提供了用于RNA-Seq,miRNA-Seq,ChIP-Seq,RNAEditing和全基因组/全外显子组测序数据的主要分析管道。 Cirrus用户无需在本地计算机上安装这些管道的任何生物信息学工具,因为所有计算均使用AWS集群执行,并且所有结果均上


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