EvidentialGene:真核生物的证据指导基因构建-开源

时间:2024-05-20 15:10:09
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文件名称:EvidentialGene:真核生物的证据指导基因构建-开源

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更新时间:2024-05-20 15:10:09

开源软件

EvidentialGene是一个基因组信息学项目,“真核生物的循证基因构建”,旨在为动物和植物构建高质量,准确的基因集,这是由印第安纳大学的Don Gilbert开发的,请参见http://arthropods.eugenes.org/EvidentialGene/构建指的是经典基因预测与更新的基因组装(de-novo和基因组辅助)方法的结合。 基本的Evigene方法涉及使用可用的同类最佳基因预测和组装软件,将来自表达序列,基因组组装序列,相关物种蛋白质序列以及所有其他基因的所有证据进行组合,以注释和评分基因构建。 通过基因证据对过量生产的构建物进行分类,以获取每个“基因座”的最佳质量,包括基因组对齐和基因转录本对齐(无基因组)基因座鉴定。 为EvidentialGene开发的所有软件均可公开获得。 请参阅项目Wiki /博客中的注释。


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