【文件属性】:
文件名称:ncbi_downloader
文件大小:1KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-02-21 10:40:37
Python
ncbi_downloader
一个简单的脚本,用于以fasta格式下载ncbi序列。
先决条件
生物蟒
pip install biopython
指示
使用python3运行,第一个参数是数据库,第二个参数是search_term(如果有空格,则带“”)。
例子:
python3 ncbi_downloader.py nucleotide "Psammodromus algirus[organism], cytb[gene]"
作者
罗德里戈·戈麦斯(Rodrigo Gomes)
迪奥戈·阿尔梅达(Diogo Almeida)
布鲁诺·佩德罗(Bruno Pedro)
【文件预览】:
ncbi_downloader-master
----ncbi_downloader.py(733B)
----README.md(438B)