【文件属性】：
文件名称：jabba:读取PacBio数据的纠错工具
文件大小：106KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-12 00:49:39
C++
贾巴
Jabba，一种用于序列读取的混合错误纠正工具。
要构建Jabba，请在jabba文件夹中运行以下命令：
> mkdir -p build
> cd build
> cmake ../
> make
请参阅以开始使用。 在阅读论文。
【文件预览】：
jabba-master
----.gitmodules(165B)
----compile.sh(454B)
----LICENSE(34KB)
----src()
--------readfile()
--------AlignedRead.hpp(3KB)
--------InexactSeed.hpp(2KB)
--------TString.hpp(9KB)
--------ReadCorrectionHandler.cpp(2KB)
--------Read.hpp(3KB)
--------TString.cpp(10KB)
--------Alignment.cpp(6KB)
--------ReadCorrection.cpp(671B)
--------GraphChain.cpp(4KB)
--------ReadCorrectionHandler.hpp(4KB)
--------util.h(3KB)
--------util.cpp(3KB)
--------library.h(15KB)
--------GraphChain.hpp(3KB)
--------Input.hpp(3KB)
--------Seed.hpp(4KB)
--------LocalAlignment.hpp(3KB)
--------SeedFinder.cpp(6KB)
--------Settings.hpp(3KB)
--------library.cpp(23KB)
--------ReadLibrary.cpp(4KB)
--------Settings.cpp(9KB)
--------ReadLibrary.hpp(2KB)
--------TNode.hpp(3KB)
--------IntraNodeChain.hpp(3KB)
--------mummer()
--------SeedFinder.hpp(4KB)
--------InterNodeChain.cpp(18KB)
--------Graph.hpp(5KB)
--------AlignedRead.cpp(7KB)
--------Nucleotide.hpp(10KB)
--------CMakeLists.txt(347B)
--------IntraNodeChain.cpp(6KB)
--------Alignment.hpp(4KB)
--------Graph.cpp(13KB)
--------InterNodeChain.hpp(6KB)
--------Nucleotide.cpp(2KB)
----karect()
----.gitignore(35B)
----CMakeLists.txt(2KB)
----README.md(365B)
----brownie()