【文件属性】:
文件名称:sambamba:用于处理SAMBAM数据的工具
文件大小:739KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-06 10:39:22
bioinformatics sam bam D
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桑巴姆巴
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检查清单:
行为守则
编译Sambamba
编译依赖
为Linux编译GNU Guix
为Mac OS X编译
发展
调试和故障排除
某些英特尔至强处理器上的段错误
转储核心
使用catchsegv
使用gdb
执照
信用
介绍
Sambamba是用D编程语言编写的高性能,高度并行,健壮且快速的工具(和库),用于处理SAM和BAM文件。 由于其高效性,Sambamba是当今世界许多测序中心运行的重要工作马。 截至2020年11月,Sambamba已被引用超过450次,并且已从Conda安装超过18万次。 Sambamba也由Debian发行。
当前功能是samtools功能的重要子集,包括视图,索引,排序,标记和深度。 大多数工具都支持管道:只需将/dev/stdin或/dev/stdout为文件名即可。 当我