【文件属性】:
文件名称:flowsaber:基于数据流的工作流框架
文件大小:17.68MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-31 15:15:59
workflow snakemake nextflow dataflow workflow-framework
基于数据流的工作流框架。
工作正在进行中
特征
类似数据流的任务组成语法,其语法来自的DSL2。
基于Python:随时导入/编写/修改Task / Flow对象。
本地缓存。
基于ray的群集支持。
Conda和Container执行环境。
例子
这是的重写版本
from flowsaber import *
# EnvTask is the real dependent task when using conda/image option
EnvTask . DEFAULT_CONFIG = { 'workdir' : '/tmp/Env' } # make the EnvTask cache at a global place
@ shell ( conda = "bwa=0.7.17 samtools=1.9" )
def bwa ( self , fa : File ,