【文件属性】:
文件名称:dce:寻找生物途径中的因果关系
文件大小:452KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-27 23:08:02
R
dce
计算对(生物)网络的不同因果影响。
安装
从Bioconductor安装最新的稳定版本:
BiocManager :: install( " dce " )
从GitHub安装最新的开发版本:
remotes :: install_github( " cbg-ethz/dce " )
项目结构
. :R包
inst/scripts/ :Snakemake工作流程,用于出版物中的所有调查
crispr_benchmark :实际数据验证
ovarian_cancer :卵巢癌如何失调通路?
synthetic_benchmark :综合数据验证
tcga_pipeline :计算来自TCGA的数据加载的效果
发展须知
在本地检查包裹:
Rscript -e "lintr::lint_package()"
Rscript -e "devtools::test()"
Rs