【文件属性】：
文件名称：openmm_rigidbody_plugin:OpenMM的刚体动力学
文件大小：145KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-16 16:03:52
molecular-dynamics openmm rigid-bodies C++
OpenMM刚体插件
在该项目中，为实现了刚体的动力学，该动力学具有以下新功能：
一个RigidBodyIntegrator类，用于对由刚体和*原子组成的系统执行运动的哈密顿运动方程的辛，时间可逆且体积守恒的积分。
ForceField类的扩展，它允许定义刚体模板以及创建包含刚体的系统。
StateDataReporter类的扩展，它能够显示正确的温度（考虑到减少的*度数）以及动能的平移和旋转部分。
该插件基于官方的构建。
公式
如果您使用此插件，请引用包含使用公式的论文：
Silveira and Abreu，Journal of Chemical Physics 2017，147，124104，doi：
以Bibtex格式：
@article{Silveira_and_Abreu_2017,
doi = {10.1063/1.5003636},
y
【文件预览】：
openmm_rigidbody_plugin-master
----.travis.yml(2KB)
----cmake()
--------Findcodecov.cmake(8KB)
--------FindOpenCL.cmake(3KB)
--------FindLcov.cmake(12KB)
--------FindGcov.cmake(5KB)
----openmmapi()
--------include()
--------src()
----serialization()
--------tests()
--------include()
--------src()
----python()
--------imports.py(111B)
--------rigidbodyplugin.i(2KB)
--------statedatareporter.py(4KB)
--------setup.py(1KB)
--------CMakeLists.txt(1004B)
--------forcefield.py(7KB)
----tests()
--------TestRigidBodyIntegrator.h(11KB)
----LICENSE(1KB)
----TODO.md(212B)
----platforms()
--------cuda()
--------opencl()
--------reference()
----.gitignore(297B)
----.codecov.yml(15B)
----CMakeLists.txt(5KB)
----Makefile(441B)
----README.md(9KB)