mutinack:变异检测程序

【文件属性】：
文件名称：mutinack:变异检测程序
文件大小：60MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-16 14:02:09
Java 一般注意事项 “ Mutinack”是一个程序，使用Illumina对按照SIP-HAVA-Seq方案制备的微量起始原料进行配对末端测序，从而检测全基因组突变，其错误率估计低至〜10 -10 。在随附的手稿[ ]中（有关双链测序方法的原始报告，请参见[ ]）。 Mutinack可以报告有关自定义BED文件中定义的任何基因组区域的突变和上/下链分歧的详细统计信息。 虽然Mutinack最初主要是考虑到DNA-Seq的设计，但它通常可以用于折叠RNA-Seq读段，以使每个分子在cDNA文库中仅保留一组读段，从而在定量基因表达时将噪音降至最低（请参见[ ]）。 安装和构建Mutinack Mutinack是一个Java程序，其所有依赖项都预先打包在单个mutinack.jar文件中。 唯一的运行时要求是Java> = 8运行时（以及GNU make和带有模块File :: Grep的