cfDNA:cfDNA分析工作流程

时间:2021-04-19 17:40:20
【文件属性】:
文件名称:cfDNA:cfDNA分析工作流程
文件大小:8.13MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-04-19 17:40:20
Python Snakemake工作流程:通过无细胞DNA片段化模式捕获的表观遗传信号分析 该存储库包含snakemake工作流程,用于分析无细胞DNA片段化模式捕获的表观遗传信号。 以下分析基于以下出版物: Snyder MW,Kircher M,Hill AJ,Daza RM,ShendureJ。无细胞DNA包含体内核小体足迹,该信息通知了其来源组织。 细胞。 2016年1月14日; 164(1-2):57-68。 doi:10.1016 / j.cell.2015.11.050。 考研PMID: 有关此分析的更多详细。 所有脚本和二进制文件均按原样提供,没有任何担保,使用后果自负。 这不是发行的软件包。 我们仅提供此信息和代码,并仅提供使方法易于重现分析的方法的描述。 我们不为这些脚本提供任何支持。 目录 工作流程 窗口保护得分叠加 描述 输入 输出 基因表达分析 描述 输入 输出
【文件预览】:
cfDNA-master
----.gitattributes(66B)
----workflow()
--------envs()
--------scripts()
--------schemas()
----snakefile_WPS.smk(8KB)
----config()
--------README.md(3KB)
--------regions.tsv(58B)
--------example.config.yml(1KB)
--------samples.tsv(288B)
----LICENSE(1KB)
----README.md(10KB)
----resources()
--------blacklists()
--------protein_atlas()
--------genome()
--------README.md(1KB)
--------annotations()
----.editorconfig(249B)
----.gitignore(511B)
----CHANGELOG.md(1KB)
----snakefile_GE_analysis.smk(7KB)

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