文件名称：AtacWorks:基于深度学习的Atac-seq数据处理
文件大小：17.17MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-06 09:02:42
JupyterNotebook
AtacWorks AtacWorks是一个深度学习工具包，用于从低覆盖率或低质量的ATAC-Seq数据进行覆盖范围跟踪降噪和峰值调用。 安装 系统要求 Ubuntu 16.04以上 CUDA 9.0+ Python 3.6.7以上 海湾合作委员会5+ （可选）conda或virtualenv设置 任何支持CUDA 9.0+的NVIDIA GPU AtacWorks培训和推理当前无法在CPU上运行。 PyPI安装 要在您的环境中安装atacworks，请在终端中运行以下命令 pip install atacworks==0.3.0 Docker安装 如果您想跳过所有安装并改为使用预安装的Docker映像，请按照“预安装的AtacWorks”部分中的说明进行操作。 如果要提取包含AtacWorks源代码的docker映像，请按照“源代码中的AtacWorks”部分的说明进行操作。