【文件属性】:
文件名称:matlab代码中cubic是什么意思-ELM:用于椭球体定位显微镜的MATLABGUI
文件大小:3.22MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-20 19:20:34
系统开源
matlab代码中cubic是的英文椭球体定位显微镜(ELM)软件
用于椭球体定位显微镜(ELM)的MATLAB软件。
剑桥大学的Eric
J.
Rees和James
D.
Manton。
2016年。许可证:CC-BY
4.0。
椭圆形定位显微镜的原理在以下开放获取的论文中进行了介绍,同时还对巨大芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌中的某些外壳蛋白位置进行了测量:
该软件包是Manetsberger论文中使用的方法的更完善和全面的版本。
本文随附说明和技术细节:
[James
D.
Manton,Robert
D.
Turner,姚晓,Graham
Christie,Eric
J.
Rees。
ELM:荧光壳结构的宽视场图像的超分辨率分析。]
如果您使用此软件来发表论文,请引用这些论文。
在与我们的某些出版物相关的打开数据文件夹中提供了示例图像数据。
荧光壳分析存储库还包括用于类似分析圆柱形荧光壳的初步代码
内容
背景
图形用户界面
准备图像进行分析
结果示例
如何使用此ELM软件
如何读取和解释ELM软件的数值结果
如何使用圆柱壳分析
笔记
1.背景
ELM是一种图像分析工具,旨在评估细菌外壳中
【文件预览】:
ELM-master
----+fsa()
--------fit_ellipsoid.m(2KB)
--------elm_spherical_analysis.m(5KB)
--------fit_ellipsoid_nelder_meade.m(1KB)
--------tile_reconstruction.m(500B)
--------cross_section_sphere_thin.m(1KB)
--------image_ellipsoid_biased.m(2KB)
--------segment_shells.m(527B)
--------elm_analysis.m(810B)
--------tile_segments.m(655B)
--------cross_section_ellipsoid_biased.m(3KB)
--------elm_ellipsoidal_analysis.m(7KB)
--------image_sphere_thin.m(1KB)
--------find_circular_shells.m(3KB)
--------fit_sphere_thin.m(1KB)
----development_notes.md(9KB)
----cylindrical_analysis()
--------sim_all_cylinders.m(3KB)
--------cylindrical_analysis.m(4KB)
--------image_cylWall_Monte.m(1KB)
--------simOverlay.png(287KB)
--------wall_analysis_v1.m(5KB)
--------fitCylWallParams.m(7KB)
----doc()
--------ELM_gui_advanced.png(9KB)
--------ELM user guide_2017_09_26.pptx(1.46MB)
--------ELM_gui.png(13KB)
--------sample_spreadsheet_out.png(18KB)
--------quantitation.png(164KB)
--------good_image.png(35KB)
--------ELM_demo.gif(26KB)
----advanced_settings.m(12KB)
----example_images()
--------cylinders()
--------ellipsoids()
--------spheres()
----ELM.fig(16KB)
----README.md(20KB)
----make_single_spore_reconstruction.m(2KB)
----advanced_settings.fig(19KB)
----ELM.m(9KB)
----.gitignore(17B)
----+example_analysis()
--------make2ColorRecon.m(6KB)
--------tile_assessed_segments.m(1KB)
--------analyse_ELM_results.m(8KB)