【文件属性】:
文件名称:matlab画二元函数代码-plmc:从序列变异推断蛋白质和RNA的偶联
文件大小:525KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-24 06:37:23
系统开源
matlab画二元函数代码聚氯乙烯
plmc推断描述生物序列家族中的协同进化和协变。
使用多序列比对作为输入,plmc可以量化推断出的所有位置对之间的偶联强度(couplingsfile输出),或推断用于预测突变或设计新序列的序列的生成模型(paramfile输出)。
用法
plmc
[options]
alignmentfile
plmc
-c
couplingsfile
alignmentfile
plmc
-o
paramfile
-c
couplingsfile
alignmentfile
plmc
[-h
|
--help]
Required
input:
alignmentfile
Multiple
sequence
alignment
in
FASTA
format
Options,
output:
-c
--couplings
couplingsfile
Save
coupling
scores
to
file
(text)
-o
--output
paramfile
Save
estimated
parameters
to
file
(binary)
Options,