文件名称:MATLAB用拟合出的代码绘图-DOC:差异重叠曲线分析
文件大小:17KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-10 10:45:49
系统开源
MATLAB用拟合出的代码绘图 DOC:差异重叠曲线分析 这是由以下人员提出的DOC分析的实现 此实现在一个重要方面与原始实现不同: 代替对观察到的数据仅计算一次Fns值,而是为每个自举实现计算Fns值,从而有可能评估该措施的鲁棒性。 除此之外,我还想尽可能地模仿原始的Matlab代码,尽管请注意,R和Matlab中的健壮的lo(w)ess算法可能会给出略有不同的结果。 该软件的引文: 该函数并行运行,设置cores参数以启用此功能。 安装 library(devtools) install_github("Russel88/DOC") # Plotting requires the ggplot2 package install.packages("ggplot2") 运行分析 results <- DOC(otu) 输入是带有分类单元作为行的OTU表 绘制结果 plot(results) 垂直线是拟合线的负斜率的中值重叠。 DOC为空模型 results.null <- DOC.null(otu) 合并两个或多个DOC对象,并绘制整个图 # The names (res1, res
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DOC-master
----NAMESPACE(329B)
----DESCRIPTION(477B)
----R()
--------DOC.loess.R(1KB)
--------DOC.boot.R(5KB)
--------DOC.rjsd.R(387B)
--------DOC.do.R(2KB)
--------plot.DOC.R(3KB)
--------DOC.merge.R(1KB)
--------DOC.null.R(2KB)
--------DOC.ci.R(502B)
--------DOC.otunull.R(735B)
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----.travis.yml(35B)
----.Rbuildignore(12B)
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----man()
--------DOC.rjsd.Rd(384B)
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--------DOC.merge.Rd(431B)
--------DOC.null.Rd(628B)
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--------plot.DOC.Rd(330B)
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--------DOC.boot.Rd(1KB)
----.gitignore(29B)