文件名称:matlabami代码-DSINMF:DSINMF
文件大小:22KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-27 14:59:48
系统开源
matlab ami代码基于深度双随机图正则化矩阵分解的单细胞RNA测序检测细胞类型 概述: 这是在论文“实验”部分给出的基于深度双随机图正则化矩阵分解的单细胞RNA测序中检测细胞类型的代码。这里的编码是论文中给出的算法的概括。 DSINMF 是用 MATLAB 编程语言编写的。 要使用,请下载 DSINMF 文件夹并按照 README.doc 中提供的说明进行操作。 文件: run_DSINMF.m - 主要功能。 factorization_AB.m - 降维 factorization_BF.m - 深度矩阵分解 constructW.m - 计算相邻矩阵 W。 NormalizeUV.m - 标准化数据。 bestMap.m - 置换 L2 的标签以尽可能匹配 L1。 compute_NMI.m - 用于计算两个聚类之间的归一化互信息 (NMI) 的程序。 AMI.m - 用于计算两个集群之间调整后的互信息 (AMI) 的程序。 ARI.m - 用于计算两个聚类之间的调整后的兰德指数 (Hubert & Arabie) 的程序。 Hungarian.m - 使用匈牙利方法解决分
【文件预览】:
DSINMF-main
----hungarian.m(11KB)
----SK_normalize.m(334B)
----bestMap.m(710B)
----excute_run_DSINMF.m(691B)
----ARI.m(1KB)
----AMI.m(4KB)
----run_DSINMF.m(2KB)
----softx.m(311B)
----compute_NMI.m(803B)
----NormalizeUV.m(847B)
----README.md(2KB)
----README.doc(20KB)
----function_ds.m(142B)
----constructW.m(19KB)
----factorization_BF.m(3KB)
----factorization_AB.m(3KB)