【文件属性】：
文件名称：matlabami代码-DSINMF:DSINMF
文件大小：22KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-06-07 21:13:08
系统开源
matlab
ami代码基于深度双随机图正则化矩阵分解的单细胞RNA测序检测细胞类型
概述：
这是在论文“实验”部分给出的基于深度双随机图正则化矩阵分解的单细胞RNA测序中检测细胞类型的代码。这里的编码是论文中给出的算法的概括。
DSINMF
是用
MATLAB
编程语言编写的。
要使用，请下载
DSINMF
文件夹并按照
README.doc
中提供的说明进行操作。
文件：
run_DSINMF.m
-
主要功能。
factorization_AB.m
-
降维
factorization_BF.m
-
深度矩阵分解
constructW.m
-
计算相邻矩阵
W。
NormalizeUV.m
-
标准化数据。
bestMap.m
-
置换
L2
的标签以尽可能匹配
L1。
compute_NMI.m
-
用于计算两个聚类之间的归一化互信息
(NMI)
的程序。
AMI.m
-
用于计算两个集群之间调整后的互信息
(AMI)
的程序。
ARI.m
-
用于计算两个聚类之间的调整后的兰德指数
(Hubert
&
Arabie)
的程序。
Hungarian.m
-
使用匈牙利方法解决分
【文件预览】：
DSINMF-main
----hungarian.m(11KB)
----SK_normalize.m(334B)
----bestMap.m(710B)
----excute_run_DSINMF.m(691B)
----ARI.m(1KB)
----AMI.m(4KB)
----run_DSINMF.m(2KB)
----softx.m(311B)
----compute_NMI.m(803B)
----NormalizeUV.m(847B)
----README.md(2KB)
----README.doc(20KB)
----function_ds.m(142B)
----constructW.m(19KB)
----factorization_BF.m(3KB)
----factorization_AB.m(3KB)