【文件属性】：
文件名称：中文matlab加载代码-TPGLDA:通过lncRNA-疾病-基因三方图预测lncRNA与疾病之间的关联的新方法
文件大小：282KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-22 18:42:54
系统开源
中文matlab加载代码TPGLDA
通过lncRNA-疾病-基因三方图预测lncRNA与疾病之间的关联的新方法
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TPGLDA软件说明（版本1.0.0）
开发者：中国科学技术大学信息科学与技术学院健康信息学实验室的丁亮
要求
4GB内存
MATLAB
R2015a或更高版本
相关数据信息需要首先载入三方图中
/data/known_lncRNA_disease_interaction.txt
/data/known_gene_disease_interaction.txt
第一个文本文件known_lncRNA_disease_interaction.txt是疾病和lncRNA之间的已知二进制关联表。
第二个文本文件known_gene_disease_interaction.txt是一个表格，列出了基因与疾病之间的已知二进制关联。
运行TPGLDA以推断lncRNA与疾病之间的潜在关联
我们提供了有关lncRNA_疾病关联和基因疾病关联的实验验证数据。
为了在TPGLDA上分析这些数据以进一步推断lncRNA与疾病之间的潜在关联，您应该
【文件预览】：
TPGLDA-master
----data()
--------diseasesimilarity.txt(572KB)
--------known_gene_disease_interaction.txt(492KB)
--------known_lncRNA_disease_interaction.txt(40KB)
--------lncRNA_115.txt(855B)
--------disease_178.txt(4KB)
--------lncRNAsimilarity.txt(231KB)
----LOOCV_TPGLDA()
--------TPGLDA.m(2KB)
--------diseasesimilarity.txt(572KB)
--------LOOCV.m(987B)
--------Sim_lnc.m(201B)
--------README.md(219B)
--------lncRNAsimilarity.txt(231KB)
--------roc.m(350B)
--------Sim_dis.m(292B)
----LICENSE(34KB)
----TPGLDA_R()
--------man()
--------NAMESPACE(31B)
--------TPGLDA_LOOCV()
--------R()
--------DESCRIPTION(386B)
--------README.md(6KB)
--------Read-and-delete-me(420B)
----.gitignore(500B)
----TPGLDA_matlab()
--------final prediction candidate pairs.xls(524KB)
--------TPGLDA.m(3KB)
--------README.md(6KB)
----README.md(6KB)