batch4_diafoirus_fleming:弗莱明项目的回购(对死亡威胁的动态预测)

时间:2024-05-29 21:43:26
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文件名称:batch4_diafoirus_fleming:弗莱明项目的回购(对死亡威胁的动态预测)

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更新时间:2024-05-29 21:43:26

machine-learning healthcare medical-information mortality-prediction JupyterNotebook

团队3-弗莱明(Fleming) 以亚历山大·弗莱明(1881-1955),前苏格兰医师,微生物学家和药理学家的名字命名,1945年诺贝尔生理学或医学奖,以发现溶菌酶和世界上第一种抗生素(青霉素G)而闻名。 该项目的主要目标是在几天内动态预测给定患者的死亡风险。 会议记录 04/04/2018 数据探索 关于如何组成队列的讨论(年龄,性别,平均胆固醇,平均心率,平均动脉压,身高,体重,过敏数量等), 要获得的重要统计数据:每单位住院时间(对观察次数的影响),诊断和按年划分的死亡率和发生率,每单位同病心率,同类人群经典指标的统计数据。 2018年04月11日 展示OMOP的优点: 可以测试OMOP格式 去做 直接在python中访问MIMIC PostGreS 对所有主要指标(SOFA,IGS-II)进行基准测试,并编写脚本进行计算。 进行完整的EDA(jupyter笔记本


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batch4_diafoirus_fleming-master
----omop_data_preprocessing.ipynb(99KB)
----omop_connection.ipynb(41KB)
----omop_create table.ipynb(4KB)
----omop_create dataset.ipynb(127KB)
----omop_severity_scores()
--------omop_create_sofa_dataset.ipynb(108KB)
--------Untitled.py(9KB)
--------omop_sapsii_components.ipynb(138KB)
--------omop_saps_ii_draft.ipynb(31KB)
--------scores_for_demo_day.ipynb(856KB)
--------omop_sapsii_proxi.ipynb(139KB)
--------__init__.py(190B)
--------sofa_preparation_code.ipynb(43KB)
--------Define_Linearized_SOFA_score.ipynb(136KB)
----presentation_omop.ipynb(47KB)
----__init__.py(87B)
----sql_queries()
--------cause_of_death.sql(743B)
--------stats.sql(2KB)
--------cohort.sql(912B)
----user()
--------README.md(382B)
----README.md(6KB)
----fleming_lib()
--------severity_scores.py(10KB)
--------untitled(0B)
--------preprocessing.py(3KB)
--------utils.py(9KB)
--------dataset.py(9KB)
--------__init__.py(86B)
--------metrics.py(4KB)
--------untitled1(0B)
--------paths.py(1KB)
--------tools.py(2KB)
----omop_build_data.py.ipynb(36KB)
----omop_eda.ipynb(244KB)
----omop_create_dataset_mini.ipynb(4KB)
----.gitignore(64B)

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