【文件属性】：
文件名称：matlab代码sqrt-Dynamic-LPBoost-for-TCR-Classification:动态LPBoostforTCR分类
文件大小：12KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-23 21:50:16
系统开源
Matlab代码sqrt
动态LPBoost
for
TCR分类
要运行代码，您将需要安装Matlab工具箱CVX。
下载和文档可在以下网站找到：。
功能说明：
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数据处理
（1）DataProcessing.py
一个用于计算长度为p的子字符串和氨基酸文档之间的p谱字符串内核的python文件。
请注意，DataProcessing.py生成的数据尚未标准化。
对于我们实验中长度为p的简单p谱核，可以通过以下代码计算归一化数据矩阵：
data_norm
=
bsxfun（@ridivide，数据，sqrt（sum（data。^
2，2）））
其中data_norm是规范化的数据矩阵。
-LPBoost
该文件夹包含具有明确功能空间的LPBoost功能。
（1）LPBoostYS.m
Matlab函数来执行LPBoost。
请注意，由于数据矩阵仅包含非负值，因此我们复制矩阵data_dup
=
[data_norm，-data_norm]，并在LPBoost中使用data_dup。
（2）LPcvx.m
一个Matlab函数，用于在LPBoost迭代过程中执行凸优化。
-动态编程
【文件预览】：
Dynamic-LPBoost-for-TCR-Classification-master
----SampleCode.m(1KB)
----Data Processing()
--------DataProcessing.py(2KB)
----LPBoost()
--------LPBoostYS.m(837B)
--------LPBoost.py(2KB)
--------LPcvx.m(471B)
----Dynamic Programming LPBoost()
--------featSelectUnnorm.m(432B)
--------dynamicLPBoostUnnorm.m(1KB)
--------dynamicPosNegUnnorm.m(921B)
--------dynamicPUnnorm.m(1KB)
----Varying Transition Probabilities (not used anymore)()
--------dynamicPosNegVary.m(916B)
--------dynamicLPBoostVary.m(1KB)
--------featSelectVary.m(379B)
--------dynamicPVary.m(1KB)
----README.md(2KB)