gam-ngs:NGS基因组组装合并

时间:2021-05-07 13:31:50
【文件属性】:
文件名称:gam-ngs:NGS基因组组装合并
文件大小:413KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-07 13:31:50
C++ ##构建说明 ###需要包装 gcc> = 4.4 cmake zlib 提升库> = 1.44 谷歌稀疏哈希 注意:建议您安装以前版本软件包的最新版本。 ###如何构建应用程序 $ cd gam-ngs $ mkdir build $ cd build $ cmake .. $ make GAM-NGS的可执行文件放在“ bin”子文件夹中。 ##用法 ###先决条件 对于每个程序集和每个读取库,GAM-NGS的输入都需要一个文件,其中列出了已对齐库的BAM文件。 该文件的格式必须如以下示例所示: $ cat assembly.PE.bams.txt /path/to/bam/file/master-pe-lib1.bam /path/to/bam/file/master-pe-lib2.bam <mi

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