文件名称:rad-pipeline:用于处理RADseq数据的脚本
文件大小:5KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-15 19:59:33
Shell
便于使用STACK处理3RAD数据的脚本。 解复用 1.多路分解iTru7索引 准备一个制表符分隔的条形码文件,第一列的索引序列为8 bp,第二列的ID为ID。 运行process-radtags-i7.sh脚本。 process-radtags-i7.sh \ < path> \ < path> \ < path> \ < desired> # Cannot already exist 2.克隆 运行clone_filter.py脚本。 clone_filter.py \ < path> \ < desired output
【文件预览】:
rad-pipeline-master
----run-ustacks.fish(557B)
----clone_filter.py(1KB)
----run-denovo-map.sh(2KB)
----process-radtags-i7.sh(389B)
----check-ustacks.fish(321B)
----clone-filter.sh(177B)
----process-radtags-samples.sh(517B)
----run-stacks-pipe.fish(591B)
----README.md(2KB)