【文件属性】：
文件名称：Intro-to-Shell:Unix Shell简介
文件大小：28.38MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-03 23:45:03
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命令行界面简介（shell / bash / Unix / Linux）
观众
所需的计算能力
期间
生物学家
没有任何
1天的研讨会（约6个小时，由讲师指导）
描述
该存储库包含为期1天的Shell入门课程的教学材料。 本次研讨会的重点是教学的基本技能使用命令行界面，具体bash ，教训包括for循环，shell脚本，位置参数。 该研讨会是研讨会的前提。
这些材料是为培训师主导的讲习班开发的，但也适合进行自学学习。
学习目标
了解命令行界面（bash / shell）的必要性和使用。
经验教训
以获取课程和建议时间表的链接
安装要求
Mac用户：无安装要求。 Windows用户：
数据集
这些材料由的教学团队成员开发。 这些是根据（CC BY 4.0）的条款分发的开放获取材料，只要注明原始作者和出处，就可以在任何介质中进行不受限制的使用，分发和复
【文件预览】：
Intro-to-Shell-master
----.gitignore(2B)
----schedule()
--------README.html(722KB)
--------README.md(2KB)
----lessons()
--------05_permissions_and_environment_variables.md(13KB)
--------04_loops_and_scripts.md(14KB)
--------02_searching_files.md(12KB)
--------01_the_filesystem.md(25KB)
--------.Rhistory(0B)
--------03_vim.md(9KB)
----assets()
--------images()
--------css()
----.DS_Store(10KB)
----fastqc()
--------Mov10oe_1-fastqc_report.html(9KB)
--------Icons()
--------Images()
----_config.yml(129B)
----sam.md(1KB)
----scripts()
--------mov10_fastqc.lsf(709B)
--------salmon_all_samples.sh(384B)
--------rnaseq_analysis_on_input_file.sh(2KB)
--------rnaseq_analysis_on_allfiles_for-lsf.sh(295B)
----README.md(2KB)
----lectures()
--------Intro_to_workshop.pdf(10.57MB)
--------HPC_intro_O2_short.pdf(1.61MB)
--------shell-workshop-wrapup.pdf(1.95MB)
--------Intro_to_workshop_new.pdf(10.57MB)
----img()
--------Filezilla_step1.png(146KB)
--------puttyssh.png(33KB)
--------count_matrix.png(296KB)
--------putty-5.PNG(54KB)
--------rnaseq_workflow.png(51KB)
--------vim_spider_number.png(104KB)
--------vim_insert.png(22KB)
--------pseudo_count_comparison-cufflinks.png(51KB)
--------RNAseqWorkflow.png(88KB)
--------alignmentfree_workflow_aug2017.png(101KB)
--------putty-1.PNG(59KB)
--------exp_design.png(49KB)
--------alignment_STAR_step3.png(39KB)
--------directory_structure.png(22KB)
--------gProfiler.png(147KB)
--------nano1-old.png(33KB)
--------vim_spider.png(114KB)
--------FastQC_seq_qual.png(241KB)
--------data_life_cycle_gouldv2.png(121KB)
--------alignment_STAR_step2.png(19KB)
--------salmon_quasialignment.png(62KB)
--------salmon_rstudio.png(260KB)
--------bad_quality.png(56KB)
--------rnaseq_workflow_trimming.png(49KB)
--------nano1.png(160KB)
--------FastQC_contam.png(106KB)
--------Filezilla_step2.png(82KB)
--------sam_bam.png(40KB)
--------permission-directory.png(35KB)
--------rnaseq_workflow_FASTQC.png(49KB)
--------Slide1.jpg(25KB)
--------union.png(27KB)
--------SAM_file.png(42KB)
--------alignment_STAR_step1.png(26KB)
--------pseudo_count_comparison-sailfish.png(25KB)
--------vim_quit.png(24KB)
--------gvng.jpg(99KB)
--------de_norm_counts_var.png(29KB)
--------pseudo_count_comparison.gif(66KB)
--------nano-awesome.png(47KB)
--------pseudo_count_comparison.png(152KB)
--------de_variation.png(158KB)
--------pseudo_count_comparison-star_sm.png(106KB)
--------pseudo_count_comparison-star.png(78KB)
--------pseudo_count_comparison-sailfish_sm.png(44KB)
--------igv_screenshot.png(38KB)
--------R_screenshot.png(57KB)
--------alignment_STAR_step5.png(24KB)
--------vim_postsave.png(23KB)
--------good_quality.png(40KB)
--------putty-2.PNG(54KB)
--------star.png(29KB)
--------alignmentfree_workflow_june2017.png(99KB)
--------vim_save.png(20KB)
--------workflow_alignment.png(124KB)
--------sam_bam3.png(34KB)
--------genemania.png(701KB)
--------alignment_STAR_step4.png(20KB)
--------nano2.png(38KB)
--------orchestra-outline.png(555KB)