【文件属性】:
文件名称:mdsrv:MD轨迹服务器
文件大小:9.71MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-25 03:20:52
Python
MDsrv是一个简单的服务器,可以远程访问以通过分子动力学模拟协调坐标轨迹。 它可以与NGL Viewer( )一起使用,以交互方式查看网络浏览器中分子复合物的轨迹,无论是在本地网络内还是从Internet上的任何地方。
实际观看:
特征
坐标轨迹(动画,远程访问)
支持的轨迹格式(xtc / trr,nc / netcdf,dcd,lammpstrj,xyz,binpos,hdf5,dtr,arc,tng)
支持其他轨迹格式-仅Unix和py2(mdcrd / crd,dms,trj,ent ncdf)
(分子结构,密度体积,用户交互,可嵌入)
轻量级仅坐标式弹射力读取器(通过和 )
目录
[NGL浏览器支持](#ngl浏览器支持)
文献资料
有关安装,部署,用法和脚本示例的详细信息,请参见文档。
安装
从PyPI:
pip install mdsrv
来自con
【文件预览】:
mdsrv-master
----MANIFEST.in(151B)
----mdsrv.wsgi.sample(793B)
----app.cfg.sample(570B)
----develop()
--------test.py(1KB)
--------appveyor-ci()
--------conda-recipe()
----DEVELOPMENT.md(2KB)
----versioneer.py(67KB)
----.travis.yml(3KB)
----LICENSE(2KB)
----setup.cfg(359B)
----setup.py(2KB)
----README.md(6KB)
----data()
--------md_1u19.xtc(3.04MB)
--------ala3.dcd(132KB)
--------md_1u19.part0001.xtc(1.02MB)
--------script.ngl(2KB)
--------ala3.pdb(3KB)
--------md_1u19.part0002.xtc(1.01MB)
--------md.xtc(3.01MB)
--------md_1u19.gro(374KB)
--------md.gro(1.15MB)
--------md.pdb(1.34MB)
----appveyor.yml(2KB)
----mdsrv()
--------webapp()
--------_version.py(18KB)
--------__init__.py(183B)
--------mdsrv.py(15KB)
--------trajectory.py(22KB)
----.gitignore(105B)
----apache.config.sample(605B)
----CHANGELOG.md(2KB)