【文件属性】：
文件名称：CLEAR:直接比较环状和线性RNA表达
文件大小：54.77MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-27 17:10:17
Python
清除/ CIRCexplorer3
对于C ircular和L A的计算管道inear RNAêXPRESSION甲来自R ibosomal-RNA耗尽（R ibo-）RNA-SEQ nalysis（CLEAR / CIRCexplorer3）
架构图
安装要求
软件
（> = 2.3.6）
（> = 2.0.5）
（> 1.3.6）
软件包（python 2.7 +）
（> = 0.8.4）
安装
git clone https://github.com/YangLab/CLEAR
cd CLEAR
python ./setup.py install
用法
从fastq文件开始：
usage: clear_quant [-h] -1 M1 [-2 M2] -g GENOME -i HISAT -j BOWTIE1 -G GTF
[-o
【文件预览】：
CLEAR-master
----src()
--------spReads.py(8KB)
--------run.py(10KB)
--------__init__.py(0B)
--------version.py(22B)
--------circ_quant.py(11KB)
----test()
--------test_data.tar.gz(54.78MB)
----setup.py(1KB)
----README.md(5KB)
----docs()
--------._pipeline.png(4KB)
--------pipeline.png(115KB)
----.gitignore(2KB)