【文件属性】：
文件名称：pipeline-for-isoseq:isoseq的管道
文件大小：4KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-14 16:38:31
Perl
1.质量控制
2.分类
质量控制和分类，协议版本=“ 2.3.0” id =“ RS_IsoSeq.1”，默认参数。
smrtpipe.py --distribute --params=settings.xml --output=outputdir xml:input.xml 2> smrtpipe.stderr 1> smrtpipe.stdout
3.聚类
映射和定相
perl phase_allotetraploid_pipeline.pl –flnc flnc.fastq --gmap_genome_directory database/ --gmap_genome_database databasename –outdir ./result --reference_fasta ref.fasta
根据比对进行同工型水平簇。
python collapse_isoform
【文件预览】：
pipeline-for-isoseq-master
----phase_allotetraploid_pipeline.pl(5KB)
----Soft.pm(879B)
----program.config.txt(141B)
----README.md(3KB)