【文件属性】：
文件名称：bmsr：贝叶斯多源回归
文件大小：12.14MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-03-04 10:59:31
C++
贝叶斯多源回归
bmsr软件包在贝叶斯框架中实现了来自多个数据源的联合回归。 该软件包提供了单任务和多任务回归的实现。 该模型使用STAN实现，接口使用R编程语言提供。 提供了使用NUTS采样器和变分推理训练模型的选项。 该软件包的结构易于使用，随附的演示演示了模型在现实生活中以及在模拟数据集上的执行情况。
安装
要安装该软件包，请在R中运行以下命令：
devtools :: install_github( " suleimank/bmsr " )
参考手册
该存储库包含《 R-package 。
演示版
要在模拟数据上运行贝叶斯多源回归演示，请在R中执行以下操作：
demo( ' demo_bmsr ' )
要在模拟数据上运行贝叶斯多任务回归演示，请在R中执行以下操作：
demo( ' demo_bmsmtr ' )
要对来自GDSC的真实数据以及从软件包获得的CCLE数据集运
【文件预览】：
bmsr-master
----.travis.yml(1KB)
----configure.win(134B)
----man()
--------runSTAN.Rd(856B)
--------bmsr-package.Rd(1KB)
--------demo_bmsmtr.Rd(552B)
--------posterior.bmsmtr.stan.Rd(610B)
--------predict.bmsr.stan.Rd(966B)
--------pred.Rd(801B)
--------demo_internal.Rd(768B)
--------getPosterior.Rd(472B)
--------varNorm.Rd(764B)
--------demo_bmsr_lapatinib_gdsc_ccle.Rd(561B)
--------ztransform.Rd(793B)
--------getBeta.bmsmtr.stan.Rd(446B)
--------demo_bmsr.Rd(358B)
--------ztransformTest.Rd(1022B)
--------predictSTAN.Rd(1007B)
--------generateSyntheticData.Rd(1023B)
--------predict.bmsmtr.stan.Rd(981B)
--------posterior.bmsr.stan.Rd(641B)
--------getBeta.bmsr.stan.Rd(436B)
--------meanNorm.Rd(731B)
----NAMESPACE(494B)
----inst()
--------include()
--------stan()
----LICENSE(1KB)
----src()
--------stanExports_bmsmtr.h(38KB)
--------stanExports_bmsmtr.cc(2KB)
--------bmsr.so(2.94MB)
--------stanExports_bmsr.h(35KB)
--------RcppExports.o(100KB)
--------Makevars(751B)
--------stanExports_bmsmtr.o(35.09MB)
--------stanExports_bmsr.cc(2KB)
--------Makevars.win(727B)
--------stanExports_bmsr.o(34.91MB)
--------RcppExports.cpp(718B)
----.Rbuildignore(30B)
----configure(117B)
----.gitignore(598B)
----R()
--------bmsr.R(10KB)
--------stanmodels.R(1KB)
--------bmsr_wrappers.R(6KB)
--------demo_utils.R(9KB)
--------HelpingFunctions.R(7KB)
--------dataset_utils.R(3KB)
--------bmsr-package.R(1KB)
----demo()
--------demo_bmsr.R(172B)
--------demo_bmsr_lapatinib_gdsc_ccle.R(1KB)
--------demo_bmsmtr.R(155B)
----DESCRIPTION(1KB)
----README.md(3KB)
----bmsr.Rproj(414B)
----bmsr_1.0.0.pdf(95KB)