【文件属性】:
文件名称:variantgrid:VariantGrid公共仓库
文件大小:16.58MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-02-08 13:13:35
Python
变体网格
VariantGrid是用于存储,分析和分类变量的数据库和Web应用程序。
将VCF上传到:
使用Ensembl VEP自动注释
查看所有共享变体的VCF的样本
通过实时拖放互动分析来分析和过滤样本,三重奏或同类群组
使用可自定义的ACMG表格对变体进行分类
同一数据库中的GRCh37(hg19),GRCh38,Ensembl和RefSeq(一些自动转换)
管理和整理数据,包括患者表型
它可以免费用于研究和评估,而生产商业用途则需要,然后代码才能在4年内完全免费/开源。 这是我们为未来发展获得可持续资金的尝试。 请参阅
用例
专用服务器:
南澳大利亚公共病理服务局临床/诊断用途。
的实验室研究外显子组
公开数据共享站点:
://shariant.org.au-澳大利亚基因组变体分类共享服务器
://runx1db.runx1-fpd.org-罕见血液疾病数据共享