文件名称:circos-py:Python脚本将抗体克隆的电子表格转换为杂技图解
文件大小:1.23MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-01 05:36:42
Python
马戏团 B细胞克隆作为杂技场图 编写此脚本的目的是通过将电子表格输入转换为图来说明B细胞克隆在多个时间点上的。 在这种特定情况下,橙色和蓝色表示特定的B细胞表型。 安装并设置circos-py信息库后,可以通过在命令行上导航到circos-py目录并使用示例输入数据运行make_circos_plots.py脚本来生成上述图,如下所示。 cd ~ /circos-py python make_circos_plots.py example_input_data.csv 安装 快速指南 只是Mac用户的快速入门指南:如果您尚未积极使用Python,Perl或Circos,我建议您安装 ,然后通过conda安装Perl: conda install -c anaconda perl 然后安装 ,解压缩并符号链接到usr / local / bin: cd ~/Desktop wget
【文件预览】:
circos-py-master
----make_circos_plots.py(5KB)
----example_2.png(650KB)
----example_data_input.xlsx(19KB)
----__pycache__()
--------circos.cpython-36.pyc(6KB)
----circos.py(8KB)
----example.png(646KB)
----circos_conf()
--------circos.conf(4KB)
--------circos_stem.conf(4KB)
--------circos_h7.conf(4KB)
----.gitignore(24B)
----.ipynb_checkpoints()
--------Untitled-checkpoint.ipynb(72B)
----README.md(4KB)