文件名称：single-cell-tutorial:论文的单细胞当前最佳实践教程案例研究
文件大小：42.41MB
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更新时间：2024-06-18 23:21:34
JupyterNotebook
“单细胞 RNA-seq 中的当前最佳实践：教程”的脚本 该存储库是对出版物的补充： MD Luecken, FJ Theis，“单细胞 RNA-seq 分析的当前最佳实践：教程”，分子系统生物学 15(6) (2019)：e8746 该论文被推荐在 F1000 prime 上，因为在该领域具有特殊意义。 该存储库包含： 生成纸图的脚本 补充手稿的案例研究 补充材料中标记基因检测研究的代码 该存储库的主要部分是一个案例研究，其中手稿中建立的最佳实践应用于 Haber 等人的小鼠肠上皮区域数据集，Nature 551（2018）可从 GSE92332 下的 GEO 获得。 此案例研究可以在latest_notebook/和old_releases/目录中的不同版本中找到。 plotting_scripts/ 文件夹中的脚本复制了手稿和补充材料中显示的数字。 这些脚本包含解释每个步