【文件属性】:
文件名称:contact-vis:用于简单蛋白质残基-残基接触图绘制的 Python 包
文件大小:921KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-07-02 09:04:43
Python
联系方式
用于简单蛋白质残基-残基接触图绘制的 Python 包。 。
安装
ContactVis 可以从 PyPi 安装:
pip -U ContactVis
或者
easy_install -U ContactVis
用法
在Python内:
from contactvis import plot_contact_map
plot_contact_map.plot_map(fasta_filename, contact_filename, factor, c2_filename='', psipred_filename='', pdb_filename='', is_heavy=False, chain='', sep=',', outfilename='')
终端:
[--psipred_horiz PSIPRED_HORIZ]
【文件预览】:
contact-vis-master
----setup.py(573B)
----contactvis()
--------__init__.py(0B)
--------get_avg_contact_distance.py(2KB)
--------get_avg_pconsc_score.py(1KB)
--------plot_contact_map.py(11KB)
--------parsing()
--------sort_contacts.py(528B)
--------test()
----bin()
--------plot_contact_map(2KB)
----MANIFEST.in(43B)
----dist()
--------ContactVis-0.1.1.tar.gz(7KB)
--------ContactVis-0.1.0.tar.gz(7KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(2KB)
----CHANGES.txt(304B)
----MANIFEST(474B)