matlab集成c代码-awesome-single-cell:真棒单细胞

时间:2021-05-22 04:43:38
【文件属性】:
文件名称:matlab集成c代码-awesome-single-cell:真棒单细胞
文件大小:31KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-22 04:43:38
系统开源 Matlab集成的c代码真棒单细胞 用于单细胞数据分析的软件包列表(以及开发这些方法的人员),包括RNA-seq,ATAC-seq等。... 引文 软体套件 RNA序列 - [Python] - :anchor: 在数据中查找双峰,单峰和多峰特征 -[R]-上升是一个R包,其中包含快速,简化的分析功能,这些功能经过优化,可应对单细胞RNA-seq的统计挑战。 该软件包结合了新颖且已建立的方法,以提供灵活的框架来执行过滤,质量控制,归一化,降维,聚类,差异表达和广泛的绘图。 -[Python]-考虑到单细胞RNA序列实验的内在特征而开发的聚类算法。 -[R]-单细胞RNA-seq数据的贝叶斯分析。 估计特定于单元格的归一化常数。 技术变异性是根据刺入基因进行量化的。 表达计数的总可变性被分解为技术和生物学成分。 BASiCS还可以识别在两组或更多组细胞之间差异表达/过度分散的基因。 - [Python] - -[R]-BEARscc利用ERCC插入测量来对技术差异进行建模,该技术差异是基因表达的函数以及技术对低表达基因的影响。 -[matlab]-用于大规模单细胞数据的分析框架。 - [Python]
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