MATLAB做脑区域掩膜(mask)

时间:2024-04-13 22:49:56

做掩膜有很多种方法,可以自己写程序(当然我不会,哪位仁兄可以指点我一下),也可以借助已有的软件包。

  • REST

这个是FMRI处理比较早期的一个软件,最新的是RESTplus,我把REST和RESTplus都下载了,事实证明好像一样。

 

 

MATLAB做脑区域掩膜(mask)

(好久没写,我还去查了查怎么上传图片,废了老鼻子劲,居然拖过来就好了,我??黑人问号脸,他喵的)

MATLAB做脑区域掩膜(mask)

以上就是REST和RESTplus的打开界面,个人感觉新的还不如旧的显得高级。

现在用到的是viewer部分:

underlay下放的是ch2bet.nii,overlay下放的是aal.nii,结果是这样子:

MATLAB做脑区域掩膜(mask)

如果你想要一个固定的脑区,就可以点击Misc,然后set range of threshold

MATLAB做脑区域掩膜(mask)

比如29 to 30,就可以划分出左右脑岛,然后save cluster 就好了。

  • wfu_pickatlas(简直神器)

直接在主页面打开,就是酱紫:

MATLAB做脑区域掩膜(mask)

选择Human atlas后,点击aal(AAL是一个脑区模板),就会出来所有脑区的名称,比如我想要脑岛的模板,就点击nsula_R和insula_L :

MATLAB做脑区域掩膜(mask)

点击save mask就完成了。

附:wfu pickaltas下载地址:https://www.nitrc.org/projects/wfu_pickatlas/

REST下载地址:http://restfmri.net/forum/index.php?q=rest

本文完,期待下一次会写什么~~~