安装biomaRt时遇到的问题

时间:2024-03-17 21:16:46

最近情绪低迷,研究进度缓慢,昨天下载biomaRt弄了一晚上没有弄好,结果今天耐着性子看报错,在网上查资料不到半小时就好了。所以,出错了光干着急没用的,还是要找问题的根源。
记录一下解决过程,最开始是下载biomaRt包出现的错误
安装biomaRt时遇到的问题
但是在加载这个包的时候,出现了这样的问题
安装biomaRt时遇到的问题

错误: package or namespace load failed for ‘biomaRt’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
不存在叫‘tibble’这个名字的程辑包

尝试重新下载tibble这个包,又报错
安装biomaRt时遇到的问题

*** arch - i386
c:/Rtools/mingw_32/bin/gcc -I"D:/R-36~1.3/include" -DNDEBUG -std=gnu99 -O3 -Wall -std=gnu99 -mtune=core2 -c attributes.c -o attributes.o
c:/Rtools/mingw_32/bin/gcc: not found
make: *** [attributes.o] Error 127
ERROR: compilation failed for package ‘tibble’
*removing ‘D:/R-3.6.3/library/tibble’
Warning in install.packages :
installation of package ‘tibble’ had non-zero exit status

注意到这句

There is a binary version available but the source version is later: binary source needs_compilation
tibble 3.0.0 3.0.1 TRUE

所以直接去这个网址下载二进制的tibble包后,放在安装R的文件夹的library路径下。
安装biomaRt时遇到的问题
再试着加载一下,ok,大功告成。希望能对遇到相同问题的人有帮助。
安装biomaRt时遇到的问题