方法一：
到C盘（系统盘）,系统文件夹（c:windows）下的ADVPCB99SE和ADVSch99SE文件先配置原理图图,用本文打开ADVPCB99SE文件,在[Change Library File List]下找到File0,可以发现,等号后面的的内容就是默认已经添加的库,把这个改为我们自定义的库（记得路径要正确）,在打开99,默认添加的就是我们的库了,如果要添加多个就在File0后面添File1,File2..依次类推,但注意最后修改File0上面的Count属性,如果你添了两个,就把它的值改为2.举个例子:
Count=2
File0=d:Program FilesDesign Explorer 99 SELibrarySchDPT8_PCBSch（2007-07-24）.ddb
File1=d:Program FilesDesign Explorer 99 SELibrarySchProtel DOS Schematic Libraries.ddb
2.修改PCB的库配置,同样用文本打开ADVPCB99SE文件,在[PCB Libraries]下找到File0进行修改或添加,举个例子参考:
Count=5
File0=D>MSACCESS$RP>D:Program FilesDesign Explorer 99 SELibraryPcbGeneric Footprints$RN>Advpcb.ddb$OP>$ON>Footprints.lib$ID>-1$ATTR>0$E>$CBLIB$STF>
File1=D>MSACCESS$RP>D:Program FilesDesign Explorer 99 SELibraryPcbGeneric Footprints$RN>Advpcb.ddb$OP>$ON>General IC.lib$ID>-1$ATTR>0$E>$CBLIB$STF>
File2=D>MSACCESS$RP>D:Program FilesDesign Explorer 99 SELibraryPcbGeneric Footprints$RN>Advpcb.ddb$OP>$ON>Headers.lib$ID>-1$ATTR>0$E>$CBLIB$STF>
File3=D>MSACCESS$RP>D:Program FilesDesign Explorer 99 SELibraryPcbGeneric Footprints$RN>Advpcb.ddb$OP>$ON>International Rectifiers.lib$ID>-1$ATTR>0$E>$CBLIB$STF>
File4=D>MSACCESS$RP>D:Program FilesDesign Explorer 99 SELibraryPcbGeneric Footprints$RN>Advpcb.ddb$OP>$ON>Transistors.lib$ID>-1$ATTR>0$E>$CBLIB$STF>
PCB库的修改稍烦,大家必须知道DDB文件里具体PCB库的文件名才行
方法二：
第一步，打开一个你常用的PCB库，进入PCB库编辑界面，如下图所示
<IGNORE_JS_OP>
图1：打开一个PCB库
第二步：打开要加载的PCB库，也就是说在同一个protel 99se里面打开两个PCB封装库，如下图2所示
<IGNORE_JS_OP>
图2：打开第二个PCB封装库
第三步：前面两部很easy把！其实第三部也很简单，就是把你想加进去的库里面的封装都拷贝到一个封装库里面，在Browse里面的components里选中要复制的元件（复制方法和word复制方法一样），如下图所示
<IGNORE_JS_OP>
图3
然后在选中的元件上点击右键选择copy
第四步：在另外一个PCB库文件里面的在Browse里面的components里面paste就行了！然后保存，ok！
此方法虽然笨了点，但是也是一个很好的解决办法，protel 99se与vista不兼容，所以建议用vista的朋友 装altium designer