Pytorch数据读取与预处理该如何实现

时间:2022-06-23 05:46:49

  在炼丹时,数据的读取与预处理是关键一步。不同的模型所需要的数据以及预处理方式各不相同,如果每个*都我们自己写的话,是很浪费时间和精力的。Pytorch帮我们实现了方便的数据读取与预处理方法,下面记录两个DEMO,便于加快以后的代码效率。

  根据数据是否一次性读取完,将DEMO分为:

  1、串行式读取。也就是一次性读取完所有需要的数据到内存,模型训练时不会再访问外存。通常用在内存足够的情况下使用,速度更快。

  2、并行式读取。也就是边训练边读取数据。通常用在内存不够的情况下使用,会占用计算资源,如果分配的好的话,几乎不损失速度。

  Pytorch官方的数据提取方式尽管方便编码,但由于它提取数据方式比较死板,会浪费资源,下面对其进行分析。

1  串行式读取

1.1  DEMO代码

  1. import torch
  2. from torch.utils.data import Dataset,DataLoader
  3.  
  4. class MyDataSet(Dataset):# ————1————
  5. def __init__(self):
  6. self.data = torch.tensor(range(10)).reshape([5,2])
  7. self.label = torch.tensor(range(5))
  8.  
  9. def __getitem__(self, index):
  10. return self.data[index], self.label[index]
  11.  
  12. def __len__(self):
  13. return len(self.data)
  14.  
  15. my_data_set = MyDataSet()# ————2————
  16. my_data_loader = DataLoader(
  17. dataset=my_data_set, # ————3————
  18. batch_size=2, # ————4————
  19. shuffle=True, # ————5————
  20. sampler=None, # ————6————
  21. batch_sampler=None, # ————7————
  22. num_workers=0 , # ————8————
  23. collate_fn=None, # ————9————
  24. pin_memory=True, # ————10————
  25. drop_last=True # ————11————
  26. )
  27.  
  28. for i in my_data_loader: # ————12————
  29. print(i)

  注释处解释如下:

  1、重写数据集类,用于保存数据。除了 __init__() 外,必须实现 __getitem__() 和 __len__() 两个方法。前一个方法用于输出索引对应的数据。后一个方法用于获取数据集的长度。

  2~5、 2准备好数据集后,传入DataLoader来迭代生成数据。前三个参数分别是传入的数据集对象、每次获取的批量大小、是否打乱数据集输出。

  6、采样器,如果定义这个,shuffle只能设置为False。所谓采样器就是用于生成数据索引的可迭代对象,比如列表。因此,定义了采样器,采样都按它来,shuffle再打乱就没意义了。

  7、批量采样器,如果定义这个,batch_size、shuffle、sampler、drop_last都不能定义。实际上,如果没有特殊的数据生成顺序的要求,采样器并没有必要定义。torch.utils.data 中的各种 Sampler 就是采样器类,如果需要,可以使用它们来定义。

  8、用于生成数据的子进程数。默认为0,不并行。

  9、拼接多个样本的方法,默认是将每个batch的数据在第一维上进行拼接。这样可能说不清楚,并且由于这里可以探究一下获取数据的速度,后面再详细说明。

  10、是否使用锁页内存。用的话会更快,内存不充足最好别用。

  11、是否把最后小于batch的数据丢掉。

  12、迭代获取数据并输出。

1.2  速度探索

  首先看一下DEMO的输出:

Pytorch数据读取与预处理该如何实现

  输出了两个batch的数据,每组数据中data和label都正确排列,符合我们的预期。那么DataLoader是怎么把数据整合起来的呢?首先,我们把collate_fn定义为直接映射(不用它默认的方法),来查看看每次DataLoader从MyDataSet中读取了什么,将上面部分代码修改如下:

  1. my_data_loader = DataLoader(
  2. dataset=my_data_set,
  3. batch_size=2,
  4. shuffle=True,
  5. sampler=None,
  6. batch_sampler=None,
  7. num_workers=0 ,
  8. collate_fn=lambda x:x, #修改处
  9. pin_memory=True,
  10. drop_last=True
  11. )

  结果如下:

Pytorch数据读取与预处理该如何实现

  输出还是两个batch,然而每个batch中,单个的data和label是在一个list中的。似乎可以看出,DataLoader是一个一个读取MyDataSet中的数据的,然后再进行相应数据的拼接。为了验证这点,代码修改如下:

  1. import torch
  2. from torch.utils.data import Dataset,DataLoader
  3.  
  4. class MyDataSet(Dataset):
  5. def __init__(self):
  6. self.data = torch.tensor(range(10)).reshape([5,2])
  7. self.label = torch.tensor(range(5))
  8.  
  9. def __getitem__(self, index):
  10. print(index) #修改处2
  11. return self.data[index], self.label[index]
  12.  
  13. def __len__(self):
  14. return len(self.data)
  15.  
  16. my_data_set = MyDataSet()
  17. my_data_loader = DataLoader(
  18. dataset=my_data_set,
  19. batch_size=2,
  20. shuffle=True,
  21. sampler=None,
  22. batch_sampler=None,
  23. num_workers=0 ,
  24. collate_fn=lambda x:x, #修改处1
  25. pin_memory=True,
  26. drop_last=True
  27. )
  28.  
  29. for i in my_data_loader:
  30. print(i)

  输出如下:

Pytorch数据读取与预处理该如何实现

  验证了前面的猜想,的确是一个一个读取的。如果数据集定义的不是格式化的数据,那还好,但是我这里定义的是tensor,是可以直接通过列表来索引对应的tensor的。因此,DataLoader的操作比直接索引多了拼接这一步,肯定是会慢很多的。一两次的读取还好,但在训练中,大量的读取累加起来,就会浪费很多时间了。

  自定义一个DataLoader可以证明这一点,代码如下:

  1. import torch
  2. from torch.utils.data import Dataset,DataLoader
  3. from time import time
  4.  
  5. class MyDataSet(Dataset):
  6. def __init__(self):
  7. self.data = torch.tensor(range(100000)).reshape([50000,2])
  8. self.label = torch.tensor(range(50000))
  9.  
  10. def __getitem__(self, index):
  11. return self.data[index], self.label[index]
  12.  
  13. def __len__(self):
  14. return len(self.data)
  15.  
  16. # 自定义DataLoader
  17. class MyDataLoader():
  18. def __init__(self, dataset,batch_size):
  19. self.dataset = dataset
  20. self.batch_size = batch_size
  21. def __iter__(self):
  22. self.now = 0
  23. self.shuffle_i = np.array(range(self.dataset.__len__()))
  24. np.random.shuffle(self.shuffle_i)
  25. return self
  26.  
  27. def __next__(self):
  28. self.now += self.batch_size
  29. if self.now <= len(self.shuffle_i):
  30. indexes = self.shuffle_i[self.now-self.batch_size:self.now]
  31. return self.dataset.__getitem__(indexes)
  32. else:
  33. raise StopIteration
  34.  
  35. # 使用官方DataLoader
  36. my_data_set = MyDataSet()
  37. my_data_loader = DataLoader(
  38. dataset=my_data_set,
  39. batch_size=256,
  40. shuffle=True,
  41. sampler=None,
  42. batch_sampler=None,
  43. num_workers=0 ,
  44. collate_fn=None,
  45. pin_memory=True,
  46. drop_last=True
  47. )
  48.  
  49. start_t = time()
  50. for t in range(10):
  51. for i in my_data_loader:
  52. pass
  53. print("官方:", time() - start_t)
  54.  
  55. #自定义DataLoader
  56. my_data_set = MyDataSet()
  57. my_data_loader = MyDataLoader(my_data_set,256)
  58.  
  59. start_t = time()
  60. for t in range(10):
  61. for i in my_data_loader:
  62. pass
  63. print("自定义:", time() - start_t)

运行结果如下:

Pytorch数据读取与预处理该如何实现

  以上使用batch大小为256,仅各读取10 epoch的数据,都有30多倍的时间上的差距,更大的batch差距会更明显。另外,这里用于测试的每个数据只有两个浮点数,如果是图像,所需的时间可能会增加几百倍。因此,如果数据量和batch都比较大,并且数据是格式化的,最好自己写数据生成器。

2  并行式读取

2.1  DEMO代码

  1. import matplotlib.pyplot as plt
  2. from torch.utils.data import DataLoader
  3. from torchvision import transforms
  4. from torchvision.datasets import ImageFolder
  5.  
  6. path = r'E:\DataSets\ImageNet\ILSVRC2012_img_train\10-19\128x128'
  7. my_data_set = ImageFolder( #————1————
  8. root = path, #————2————
  9. transform = transforms.Compose([ #————3————
  10. transforms.ToTensor(),
  11. transforms.CenterCrop(64)
  12. ]),
  13. loader = plt.imread #————4————
  14. )
  15. my_data_loader = DataLoader(
  16. dataset=my_data_set,
  17. batch_size=128,
  18. shuffle=True,
  19. sampler=None,
  20. batch_sampler=None,
  21. num_workers=0,
  22. collate_fn=None,
  23. pin_memory=True,
  24. drop_last=True
  25. )
  26.  
  27. for i in my_data_loader:
  28. print(i)

  注释处解释如下:

  1/2、ImageFolder类继承自DataSet类,因此可以按索引读取图像。路径必须包含文件夹,ImageFolder会给每个文件夹中的图像添加索引,并且每张图像会给予其所在文件夹的标签。举个例子,代码中my_data_set[0] 输出的是图像对象和它对应的标签组成的列表。

  3、图像到格式化数据的转换组合。更多的转换方法可以看 transform 模块。

  4、图像法的读取方式,默认是PIL.Image.open(),但我发现plt.imread()更快一些。

  由于是边训练边读取,transform会占用很多时间,因此可以先将图像转换为需要的形式存入外存再读取,从而避免重复操作。

  其中transform.ToTensor()会把正常读取的图像转换为torch.tensor,并且像素值会映射至[0,1][0,1]。由于plt.imread()读取png图像时,像素值在[0,1][0,1],而读取jpg图像时,像素值却在[0,255][0,255],因此使用transform.ToTensor()能将图像像素区间统一化。

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