最近这个困惑了很久，不断的有一些坑，目前还有疑问关于iOS唤起无效时会出现弹框的问题，这个最后再说
1、首先可能需要判断当前浏览器的来源（目前开发的App还没有上架，所以针对腾讯出品的大家广为人知的微信和qq进行了特殊处理）
function GetMobelType() {
var browser = {
versions: function() {
var u = window.navigator.userAgent;
return {
trident: u.indexOf('Trident') > -1, //IE内核
presto: u.indexOf('Presto') > -1, //opera内核
Alipay: u.indexOf('Alipay') > -1, //支付宝
webKit: u.indexOf('AppleWebKit') > -1, //苹果、谷歌内核
gecko: u.indexOf('Gecko') > -1 && u.indexOf('KHTML') == -1, //火狐内核
mobile: !!u.match(/AppleWebKit.*Mobile.*/), //是否为移动终端
ios: !!u.match(/\(i[^;]+;( U;)? CPU.+Mac OS X/), //ios终端
android: u.indexOf('Android') > -1 || u.indexOf('Linux') > -1, //android终端或者uc浏览器
iPhone: u.indexOf('iPhone') > -1 || u.indexOf('Mac') > -1, //是否为iPhone或者安卓QQ浏览器
//iPhone: u.match(/iphone|ipod|ipad/),//
iPad: u.indexOf('iPad') > -1, //是否为iPad
webApp: u.indexOf('Safari') == -1, //是否为web应用程序，没有头部与底部
weixin: u.indexOf('MicroMessenger') > -1, //是否为微信浏览器
qq: u.match(/\sQQ/i) !== null, //是否QQ
Safari: u.indexOf('Safari') > -1,
///Safari浏览器,
};
}()
};
return browser.versions;
}
2、接下来需要搞清楚唤起的原理，这里请教大神，唤起是调用协议，因为我们是不能判断有没有app，只能尝试唤起，如果唤起App就是有，正常来说要将唤起当做没唤起来做，保持整个流程的稳定性，下面是唤起的代码。
经测试发现Android和iOS在微信都是不可以唤起的，所以加了一个蒙板提示在浏览器打开；在QQ里，Android是可以唤起App的，iOS不可以，所以也需要提示用户在浏览器打开。
function jump(myurl) {
var timeout = 2300, timer = null;
if(GetMobelType.weixin) {
$("#bgCoverOPen").show();
} else {
var startTime = Date.now();
if(GetMobelType.android) {
var ifr = document.createElement('iframe');
ifr.src = myurl;//这里是唤起App的协议，有Android可爱的同事提供
ifr.style.display = 'none';
document.body.appendChild(ifr);
timer = setTimeout(function() {
var endTime = Date.now();
if(!startTime || endTime - startTime < timeout + 300) {
document.body.removeChild(ifr);
window.open("唤起失败跳转的链接");
}
}, timeout);
}
if(GetMobelType.ios || GetMobelType.iPhone || GetMobelType.iPad) {
if(GetMobelType.qq) {
$("#bgCoverOPen").show(); //提示在浏览器打开的蒙板
} else {
/*var ifr = document.createElement("iframe");
ifr.src = myurl;
ifr.style.display = "none";*/ iOS9+不支持iframe唤起app
window.location.href = myurl; //唤起协议，由iOS小哥哥提供
//document.body.appendChild(ifr);
timer = setTimeout(function() {
window.location.href = "ios下载的链接";
}, timeout);
};
}
}
}
3、如上所示，这里在测试过程中发现打开App再回到网页，或者点击唤起的等待时间超出我们自己设定的时间2300时，网页会自动跳转到下载界面，这里是定时器的超出，目前没有明确的办法处理，但是加了一个处理的时间，
$(document).on('visibilitychange webkitvisibilitychange', function() {
var tag = document.hidden || document.webkitHidden;
if (tag) {
clearTimeout(timer);
}
})
$(window).on('pagehide', function() {
clearTimeout(timer);
})
结合上面 方法一起使用可以阻止界面打开App再回到网页的展示下载页面，亲测有效，但是无法阻止界面用户唤起等待不操作时间超出这一跳转。
4、另一个坑就是开始说的iOS9+iframe唤起无效，只能使用location唤起，但是会出现弹窗
这个在请教大神的时候说的都是推荐使用Universal Links，需要客户端服务端配合解决，这里因为我们的iOS小哥哥一直在修复历史bug，开发新需求，暂时没有进行，会持更新。问题相关可以在疑问帖这里查看。
大家如果有其他解决方法也可以联系我，请多多指教，蟹蟹。