pybedtools --bedtools的python包

http://daler.github.io/pybedtools/

用个下面这个

>>> fn = pybedtools.example_filename('test.fa')

>>> BedTool.seq('chr1:2-10', fn)

'GATGAGTCT'

>>> BedTool.seq(('chr1', 1, 10), fn)

'GATGAGTCT'