poj 2778 DNA Sequence ac自动机+矩阵快速幂

时间:2022-05-29 09:34:32

链接:http://poj.org/problem?id=2778

题意:给定不超过10串,每串长度不超过10的灾难基因;问在之后给定的长度不超过2e9的基因长度中不包含灾难基因的基因有多少中?

DNA:只含'A','T','C','G'四种字符;

思路:这并不是很裸的ac自动机。。没有很明显的文本串匹配过程,但是我们能过通过对灾难基因建好Trie,在跑一下失配边时需要初始化状态转移矩阵了;

状态矩阵:每一次都可以往下一个位置走四个方向,但是要求不能走到单词节点。

(mat[i][j]) ^n: 表示走了n步,i 表示从那个节点开始走,j表示最终的字符(并不是特点的字符,可以表示多个合法的字符);

即:第i个节点到第v个节点之间一步走有几种方法

        $ ans = \sum \limits _{i=0}^{\rm size} mat\left [0  \right ]\left [ i \right ]$

#include<iostream>
#include<cstdio>
#include<cstring>
#include<string.h>
#include<algorithm>
#include<vector>
#include<cmath>
#include<stdlib.h>
#include<time.h>
#include<stack>
#include<set>
#include<map>
#include<queue>
using namespace std;
#define rep0(i,l,r) for(int i = (l);i < (r);i++)
#define rep1(i,l,r) for(int i = (l);i <= (r);i++)
#define rep_0(i,r,l) for(int i = (r);i > (l);i--)
#define rep_1(i,r,l) for(int i = (r);i >= (l);i--)
#define MS0(a) memset(a,0,sizeof(a))
#define MS1(a) memset(a,-1,sizeof(a))
#define MSi(a) memset(a,0x3f,sizeof(a))
#define inf 0x3f3f3f3f
#define lson l, m, rt << 1
#define rson m+1, r, rt << 1|1
#define sqr(a) (a)*(a)
typedef pair<int,int> PII;
#define A first
#define B second
#define MK make_pair
typedef __int64 ll;
template<typename T>
void read1(T &m)
{
T x=,f=;char ch=getchar();
while(ch<''||ch>''){if(ch=='-')f=-;ch=getchar();}
while(ch>=''&&ch<=''){x=x*+ch-'';ch=getchar();}
m = x*f;
}
template<typename T>
void read2(T &a,T &b){read1(a);read1(b);}
template<typename T>
void read3(T &a,T &b,T &c){read1(a);read1(b);read1(c);}
template<typename T>
void out(T a)
{
if(a>) out(a/);
putchar(a%+'');
}
int T,kase = ,i,j,k,n,m,top;
#define mod 100000
struct Matrix{
int d[][];
Matrix(int r = ){
MS0(d);
if(r){
for(int i = ;i < top;i++)
d[i][i] = ;
}
}
Matrix operator*(const Matrix& a)const{
Matrix ans;
for(int i = ;i < top;i++)
for(int j = ;j < top;j++){
for(int k = ;k < top;k++)
ans.d[i][j] = (ans.d[i][j]+1LL*d[i][k]*a.d[k][j]) % mod;
}
return ans;
}
};
Matrix Pow(Matrix a,ll m)
{
Matrix ans();
while(m){
if(m&) ans = ans*a;
a = a*a;
m >>= ;
}
return ans;
}
int h[];
const int sigma_size = ;
const int maxn = ;
struct Aho_Corasick{
int ch[maxn][sigma_size];
int val[maxn],f[maxn],last[maxn],cnt[maxn];
int sz;
map<string,int> ms;
Aho_Corasick(){}
void init(){sz = ;val[] = ; MS0(ch[]);MS0(cnt);ms.clear();}
int idx(char c){return h[c];}
void Insert(char *s,int v){
int u = ,n = strlen(s);
for(int i = ;i < n;i++){
int c = idx(s[i]);
if(!ch[u][c]){
MS0(ch[sz]);
val[sz] = ;
ch[u][c] = sz++;
}
u = ch[u][c];
}
val[u] = v;
}
void getFail(){
queue<int> q;
f[] = ;
//初始化队列
for(int c = ;c < sigma_size;c++){
int u = ch[][c];
if(u) { f[u] = ; q.push(u); last[u] = ;}
}
while(!q.empty()){
int r = q.front();q.pop();
for(int c = ;c < sigma_size;c++){
int u = ch[r][c];
if(!u) {ch[r][c] = ch[f[r]][c]; continue;}//实现压缩
q.push(u);
int v = f[r];
while(v && !ch[v][c]) v = f[v];
f[u] = ch[v][c];
last[u] = val[f[u]]?f[u]:last[f[u]];
}
}
}
//从文本串中找模板;
Matrix Find(){
Matrix ans;
for(int i = ;i < sz;i++){
if(val[i] || last[i]) continue;//合法即可
for(int j = ;j < ;j++){ //每个节点都可以生成4个节点
int v = ch[i][j];
if(val[v] || last[v]) continue;
ans.d[i][v]++; //也可以表示第i个节点到第v个节点之间一步走有几种方法;
}
}
return ans;
}
}ac;
char p[];
int main()
{
ll n,m;
//freopen("data.txt","r",stdin);
//freopen("out.txt","w",stdout);
h['A'] = ;h['C'] = ;h['T'] = ;h['G'] = ;
ac.init();
read2(n,m);
rep1(i,,n){
scanf("%s",p);
ac.Insert(p,i);
}
top = ac.sz;
ac.getFail();
Matrix ans = ac.Find();
ans = Pow(ans,m);
int cnt = ;
rep0(i,,top)
cnt += ans.d[][i];
printf("%d\n",cnt%mod);
return ;
}